RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 CATSPER1Q8NEC5 780 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ZUFSPQ96AP4 578 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ULK4Q96C45 1275 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ZFYVE19Q96K21 471 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 GBP5Q96PP8 586 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 TRIM54Q9BYV2 358 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 CEP44Q9C0F1 390 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ATG10Q9H0Y0 220 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 PFDN4Q9NQP4 134 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ACTR3BQ9P1U1 418 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 RAB26Q9ULW5 256 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 CARNS1A5YM72 827 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ANTXRLA6NF34 631 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 MANBAO00462 879 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 PLOD2O00469 737 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 SGTAO43765 313 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 PRAMEF4O60810 478 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 B3GALT4O96024 378 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 PDYNP01213 254 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ANXA5P08758 320 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 SYN1P17600 705 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 VIPR2P41587 438 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 GRIN2CQ14957 1233 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 KIAA0040Q15053 153 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM240Q5SV17 173 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 LCN8Q6JVE9 175 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ADGRG5Q8IZF4 528 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 TSPEARQ8WU66 669 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 RAD9AQ99638 391 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 CCT7Q99832 543 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 C19orf43Q9BQ61 176 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 HEPHQ9BQS7 1158 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ACTR8Q9H981 624 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 RDH14Q9HBH5 336 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 WBP1LQ9NX94 342 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa8.68□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 PLK4O00444 970 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 RGS14O43566 566 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 DFNA5O60443 496 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 WDR47O94967 919 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 EBLN1P0CF75 366 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 SMIM18P0DKX4 95 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 HRH2P25021 359 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 PTPN5P54829 565 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 FOXM1Q08050 763 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 BNIP2Q12982 314 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 IMPG1Q17R60 797 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 PTCHD3Q3KNS1 767 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 NEK5Q6P3R8 708 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 SATL1Q86VE3 508 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 EPHX4Q8IUS5 362 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 UBTD2Q8WUN7 234 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ASB11Q8WXH4 323 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ELMO1Q92556 727 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 SEPHS2Q99611 448 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 NTMT1Q9BV86 223 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ACPTQ9BZG2 426 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ARMC1Q9NVT9 282 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 VAPAQ9P0L0 249 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 SLC22A14Q9Y267 594 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 TCRBV5S2A0A599 114 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 AQP12BA6NM10 295 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 WASH3PC4AMC7 463 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 AHCYL1O43865 530 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 CLDN9O95484 217 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 FESP07332 822 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 CBSLP0DN79 551 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 ATP6V1B1P15313 513 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 PFKLP17858 780 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 VIPR1P32241 457 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 CBSP35520 551 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 GNPDA1P46926 289 aa8.67□□□□□ -1.02
CDHR3-211ENST00000478080 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms