RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474831.5

LAMTOR4-208, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, human

TSL 3

Gene LAMTOR4, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TRIM73	Q86UV7	250 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PALM2	Q8IXS6	379 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GPATCH11	Q8N954	259 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FBF1	Q8TES7	1133 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MENT	Q9BUN1	341 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	UCK1	Q9HA47	277 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NFU1	Q9UMS0	254 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FAM159B	A6NKW6	160 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831		E5RI56	91 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	C9	P02748	559 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	APOA4	P06727	396 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PVR	P15151	417 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SAT1	P21673	171 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CCKBR	P32239	447 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CD151	P48509	253 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SEPHS1	P49903	392 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SH3BP2	P78314	561 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GPLD1	P80108	840 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CAV1	Q03135	178 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SQSTM1	Q13501	440 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KRT33B	Q14525	404 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CALML6	Q8TD86	181 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PANX3	Q96QZ0	392 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PISD	Q9UG56	409 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMTOR4-208	ENST00000474831	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KLHL33	A6NCF5	533 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR5K3	A6NET4	321 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	C1orf105	O95561	183 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GSTM1	P09488	218 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GSTM4	Q03013	218 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KCNAB1	Q14722	419 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TMED2	Q15363	201 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CEP97	Q8IW35	865 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	WDR48	Q8TAF3	677 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LCN9	Q8WX39	176 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DLG3	Q92796	817 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MAP3K3	Q99759	626 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CTRC	Q99895	268 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	APMAP	Q9HDC9	416 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZFAT	Q9P243	1243 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PDP2	Q9P2J9	529 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DHRS7	Q9Y394	339 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LAMTOR4-208	ENST00000474831	AK5	Q9Y6K8	562 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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