RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466359.1

NFX1-205, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 3

Gene NFX1, Length 391 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-205	ENST00000466359	RFPL3	O75679	317 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	C1orf105	O95561	183 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	CPNE6	O95741	557 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	C9	P02748	559 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	MPO	P05164	745 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	GSTA1	P08263	222 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	INHBA	P08476	426 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	HRH2	P25021	359 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	GCA	P28676	217 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	CD1C	P29017	333 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	CCKBR	P32239	447 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	SHMT2	P34897	504 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	GGT5	P36269	586 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	HNMT	P50135	292 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	RAB28	P51157	221 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	KIR2DS3	Q14952	304 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	NAA25	Q14CX7	972 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	ACAP2	Q15057	778 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	CYP2A13	Q16696	494 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	SYTL3	Q4VX76	610 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	SPRED1	Q7Z699	444 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	KMT5C	Q86Y97	462 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	VRK3	Q8IV63	474 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	KY	Q8NBH2	561 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	OR10G6	Q8NH81	332 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	ATL1	Q8WXF7	558 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	KIAA1191	Q96A73	305 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	CCDC138	Q96M89	665 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	C12orf66	Q96MD2	445 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	GPR21	Q99679	349 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	OLFM1	Q99784	485 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	WWP1	Q9H0M0	922 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	GPAM	Q9HCL2	828 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	GALP	Q9UBC7	116 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	WASF3	Q9UPY6	502 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	ASF1A	Q9Y294	204 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	ACOT9	Q9Y305	439 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	KNTC1	P50748	2209 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	PLXNA2	O75051	1894 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	SPEG	Q15772	3267 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359		A0A1W2PQM1	296 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359		B4DGG1	531 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	TARM1	B6A8C7	271 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	RASGRF2	O14827	1237 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	KLK8	O60259	260 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	RFPL1	O75677	317 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	UBXN7	O94888	489 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	KLHL2	O95198	593 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	C2	P06681	752 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	RBP1	P09455	135 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	TPBGL	P0DKB5	382 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	CCND1	P24385	295 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	TYK2	P29597	1187 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	CAPZB	P47756	277 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	PREP	P48147	710 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	SERPINB8	P50452	374 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	SLC18A1	P54219	525 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	SLC12A2	P55011	1212 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NFX1-205	ENST00000466359	NAA20	P61599	178 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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