RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	C5orf60	A6NFR6	353 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PRR32	B1ATL7	298 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	P2RY10	O00398	339 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	MEIS2	O14770	477 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SYNGR3	O43761	229 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	LMX1B	O60663	402 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PDE9A	O76083	593 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SLCO2B1	O94956	709 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	C22orf31	O95567	290 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	LIPF	P07098	398 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	UMOD	P07911	640 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CTAGE8	P0CG41	777 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ACHE	P22303	614 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	MCC	P23508	829 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PTAFR	P25105	342 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	MMP15	P51511	669 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ROR1	Q01973	937 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	VWC2	Q2TAL6	325 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	DET1	Q7L5Y6	550 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SMIM29	Q86T20	159 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	LONP2	Q86WA8	852 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	MFN1	Q8IWA4	741 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SPDL1	Q96EA4	605 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SFXN2	Q96NB2	322 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF583	Q96ND8	569 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1W2PPM1	405 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CCR10	P46092	362 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	LIMK1	P53667	647 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	HYAL1	Q12794	435 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PRKAA1	Q13131	559 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	KLHL26	Q53HC5	615 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	GRTP1	Q5TC63	336 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ADCK2	Q7Z695	626 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	COMMD2	Q86X83	199 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SCRN2	Q96FV2	425 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	GBP5	Q96PP8	586 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	EGFL8	Q99944	293 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ZFP57	Q9NU63	452 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	OSER1	Q9NX31	292 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1W2PPQ1	181 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM221	A6NGB7	291 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	FAM72C	H0Y354	149 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	TRIM77	I1YAP6	450 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	LINC01565	O15544	149 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	OR10H2	O60403	315 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	IGHV4-39	P01824	125 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	OR52Z1	P0C646	297 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	IFNAR1	P17181	557 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CKMT2	P17540	419 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	MARK3	P27448	753 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ACSM1	Q08AH1	577 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	FAM72B	Q86X60	149 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	METTL23	Q86XA0	190 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		3.87	□□□□□ -1.79

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