RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 IRGCQ6NXR0 463 aa6.81□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PDZD3Q86UT5 571 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM129CQ86XR2 697 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 LPGAT1Q92604 370 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM159Q96B96 161 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT12Q99456 494 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 HGH1Q9BTY7 390 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB33BQ9H082 229 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 SPHK1Q9NYA1 384 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CRYL1Q9Y2S2 319 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PCSK5Q92824 1860 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 B4E171 279 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 RAD51CO43502 376 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 HAUS5O94927 633 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 SLCO2B1O94956 709 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 FTH1P02794 183 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 EBLN1P0CF75 366 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 ST6GAL1P15907 406 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 NELFEP18615 380 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPAN7P41732 249 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CD151P48509 253 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ITGA8P53708 1063 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 CASC4Q6P4E1 433 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM73Q86UV7 250 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ACVR1CQ8NER5 493 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 IL17FQ96PD4 163 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 PRR14Q9BWN1 585 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 DPH1Q9BZG8 443 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM60AQ9NP50 221 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO8Q9NRD0 319 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PILRAQ9UKJ1 303 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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