RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450625.1

SH3BP5-207, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 763 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-207ENST00000450625 MAP10Q9P2G4 905 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP5-207ENST00000450625 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP5-207ENST00000450625 SEC16AO15027 2179 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP5-207ENST00000450625 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF749O43361 778 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 CAPN1P07384 714 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 AGXTP21549 392 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 PTPN7P35236 360 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 RPA4Q13156 261 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF789Q5FWF6 425 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 FAM198BQ6UWH4 519 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 GPR135Q8IZ08 494 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 ALS2CR12Q96Q35 445 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 C19orf43Q9BQ61 176 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 PITPNM3Q9BZ71 974 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 LUZP4Q9P127 313 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 DUSP10Q9Y6W6 482 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 RCCD1A6NED2 376 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 C9J4A7 227 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 DPM1O60762 260 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 CEACAM4O75871 244 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 HBQ1P09105 142 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 MSL3P1P0C860 447 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 RRADP55042 308 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 RAPSNQ13702 412 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 POU6F1Q14863 301 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 BRD3Q15059 726 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 NCF4Q15080 339 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 C4orf17Q53FE4 359 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 MED25Q71SY5 747 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 ZBTB2Q8N680 514 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 NUDT9Q9BW91 350 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 SLAMF7Q9NQ25 335 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 SHANK1Q9Y566 2161 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 ESPL1Q14674 2120 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 CCDC78A2IDD5 438 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 SOWAHDA6NJG2 315 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 OTX2P32243 289 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 CACNG1Q06432 222 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 ATP1A4Q13733 1029 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 DBN1Q16643 649 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 PARP6Q2NL67 630 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 MLIPQ5VWP3 458 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 SPESP1Q6UW49 350 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 TRIM73Q86UV7 250 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 PIANPQ8IYJ0 282 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 FAM71DQ8N9W8 422 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 OR5AR1Q8NGP9 310 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 ALG3Q92685 438 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 SGSM3Q96HU1 749 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 GPR83Q9NYM4 423 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 ICKQ9UPZ9 632 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 ASF1AQ9Y294 204 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 PADI2Q9Y2J8 665 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 H7C0S8 307 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 OR2B3O76000 313 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 AP2A2O94973 939 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 METTL18O95568 372 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 GSTM1P09488 218 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 GSTM4Q03013 218 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 KYNUQ16719 465 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 DEFB110Q30KQ9 67 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 C1orf189Q5VU69 101 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 KCTD11Q693B1 232 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 UNC5AQ6ZN44 842 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 RAB43Q86YS6 212 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 STYXQ8WUJ0 223 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 ELMO1Q92556 727 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
SH3BP5-207ENST00000450625 FAM60AQ9NP50 221 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms