RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 DPY30Q9C005 99 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 CLMPQ9H6B4 373 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 LRTM1Q9HBL6 345 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 H0YAE9 185 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 STK16O75716 305 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 PGRP06401 933 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 CDK4P11802 303 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 PTPN5P54829 565 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 B4GALNT1Q00973 533 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 CTBSQ01459 385 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 TTLL9Q3SXZ7 439 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 FAM86B1Q8N7N1 296 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 OR10A6Q8NH74 314 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 SEC22BO75396 215 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 IL6P05231 212 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 URODP06132 367 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 CBSLP0DN79 551 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 NFKBIAP25963 317 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 CBSP35520 551 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 ARSFP54793 590 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 CYP4F3Q08477 520 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 MPPE1Q53F39 396 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 SGO1Q5FBB7 561 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 TPRG1Q6ZUI0 275 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 GPR141Q7Z602 305 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 ITIH5Q86UX2 942 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 TMBIM1Q969X1 311 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 ECHDC3Q96DC8 303 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 SCRN2Q96FV2 425 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 KCTD5Q9NXV2 234 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 CFAP97Q9P2B7 532 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 ATXN10Q9UBB4 475 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 KIAA1671Q9BY89 1806 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 OBSL1O75147 1896 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 AREL1O15033 823 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 PARNO95453 639 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 SRCP12931 536 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 TCF3P15923 654 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 GABRR2P28476 465 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 ALDH3A2P51648 485 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 ARHGEF7Q14155 803 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 NKG7Q16617 165 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 CACHD1Q5VU97 1274 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 LRRC66Q68CR7 880 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 FIG4Q92562 907 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 LMLNQ96KR4 655 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 KLHL42Q9P2K6 505 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 PPIL1Q9Y3C6 166 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 ALPLP05186 524 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 ANXA5P08758 320 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 PCNAP12004 261 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 CCR7P32248 378 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 STK19P49842 368 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 PTSQ03393 145 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 CHRNB3Q05901 458 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 IMPG1Q17R60 797 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 RUNDC3AQ59EK9 446 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 SLC22A17Q8WUG5 538 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 ULK4Q96C45 1275 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 SLC29A3Q9BZD2 475 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 C1orf109Q9NX04 203 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 PDE10AQ9Y233 779 aa15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 TEX28O15482 410 aa15.65■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 CLDN9O95484 217 aa15.65■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 CKMP06732 381 aa15.65■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 BCKDHAP12694 445 aa15.65■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 LHCGRP22888 699 aa15.65■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 GGT5P36269 586 aa15.65■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 RPIAP49247 311 aa15.65■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 ESRRGP62508 458 aa15.65■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 SLC7A9P82251 487 aa15.65■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 PLCL1Q15111 1095 aa15.65■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 CDKL4Q5MAI5 379 aa15.65■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 ENPP6Q6UWR7 440 aa15.65■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 RFLNAQ6ZTI6 216 aa15.65■□□□□ 0.1
SHQ1-202ENST00000444040 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms