RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SPESP1Q6UW49 350 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CYHR1Q6ZMK1 362 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP97Q8IW35 865 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 AFG1LQ8WV93 481 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR22Q99680 433 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF670Q9BS34 389 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 HMX3A6NHT5 357 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BQ06 376 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 AKR7A2O43488 359 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 AIREO43918 545 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ACSL4O60488 711 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SLITRK5O94991 958 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PSAPP07602 524 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TPH1P17752 444 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TGFBR2P37173 567 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 IL12RB1P42701 662 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4D2P58180 307 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RAD51Q06609 339 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC74AQ0VAA2 488 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMD5Q16401 504 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF699Q32M78 642 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 GPAT3Q53EU6 434 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RIMKLAQ8IXN7 391 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 EID3Q8N140 333 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4M1Q8NGD0 313 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 DEDD2Q8WXF8 326 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MMP28Q9H239 520 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CPA4Q9UI42 421 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0U1RQS6 177 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 UBXN8O00124 270 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGEF9O43307 516 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP7B1O75881 506 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 GOT2P00505 430 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SFTPCP11686 197 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CFL1P23528 166 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ASPAP45381 313 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RGS7P49802 495 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPK12P53778 367 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKCDQ05655 676 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RAPSNQ13702 412 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS6KA2Q15349 733 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 XKR3Q5GH77 459 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF691Q5VV52 312 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SULT1C3Q6IMI6 304 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM135Q86UB9 458 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CCNYQ8ND76 341 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RAET1EQ8TD07 263 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 HEXDCQ8WVB3 486 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC7A6Q92536 515 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 P2RY11Q96G91 374 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR78Q96P69 363 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TWNKQ96RR1 684 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 TM9SF2Q99805 663 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF167Q9H6Y7 350 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 BFARQ9NZS9 450 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM92AA1XBS5 289 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 GNGT2O14610 69 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 DSCR3O14972 297 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PLOD3O60568 738 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CNTN5O94779 1100 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 CYBBP04839 570 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SP4Q02446 784 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 EFR3AQ14156 821 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 GRB7Q14451 532 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 LIN54Q6MZP7 749 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-203ENST00000439720 PID1Q7Z2X4 250 aa8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms