RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 PRRG1O14668 218 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 NCS1P62166 190 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 RABL3Q5HYI8 236 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 ATAD3CQ5T2N8 411 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 KCTD11Q693B1 232 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 FAAH2Q6GMR7 532 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 TAC4Q86UU9 113 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 MFSD6LQ8IWD5 586 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 TDHQ8IZJ6 230 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 NUDT5Q9UKK9 219 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 I6L893 689 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 MATN4O95460 622 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC159P0C7I6 412 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 RAB30Q15771 203 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF544Q6NX49 715 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 FAM20CQ8IXL6 584 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 DEPDC7Q96QD5 511 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 LTB4R2Q9NPC1 389 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 FBXO5Q9UKT4 447 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 MAU2Q9Y6X3 613 aa16.54■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 DOCK6Q96HP0 2047 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 KCNK1O00180 336 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 LRIG2O94898 1065 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 TPH1P17752 444 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 PRKACBP22694 351 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 SOX11P35716 441 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 RGS19P49795 217 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 ISL1P61371 349 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 GALK2Q01415 458 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 TECRLQ5HYJ1 363 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 PLD3Q8IV08 490 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 LGALS12Q96DT0 336 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 TRMOQ9BU70 441 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 MMP27Q9H306 513 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 MSRAQ9UJ68 235 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 ITM2BQ9Y287 266 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 AGAP5A6NIR3 686 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 PDZK1P1A8MUH7 402 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 H0Y626 953 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 TULP3O75386 442 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 TRIM16O95361 564 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 PTPN3P26045 913 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 HTR1EP28566 365 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 PIGAP37287 484 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 NFYCQ13952 458 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 UTS2BQ765I0 119 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 FAM131BQ86XD5 332 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 KIAA1958Q8N8K9 716 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 KREMEN2Q8NCW0 462 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 PJA1Q8NG27 643 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM246Q9BRR3 403 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 SLC52A3Q9NQ40 469 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 IGSF5Q9NSI5 407 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 COX16Q9P0S2 106 aa16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 CENPXA8MT69 81 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 C9JVG2 144 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 G3V2T6 193 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 HRH2P25021 359 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 TAS2R39P59534 338 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 TUBA1BP68363 451 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 COLEC12Q5KU26 742 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 TUBA1AQ71U36 451 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 GDPD3Q7L5L3 318 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 SLC38A6Q8IZM9 456 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 METTL4Q8N3J2 472 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 PSMG2Q969U7 264 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF566Q969W8 418 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 TRIM62Q9BVG3 475 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 GSTO2Q9H4Y5 243 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC154A6NI56 674 aa16.52■□□□□ 0.23
CNGA3-205ENST00000436404 SNX2O60749 519 aa16.52■□□□□ 0.23
CNGA3-205ENST00000436404 GLUD1P00367 558 aa16.52■□□□□ 0.23
CNGA3-205ENST00000436404 FUT11Q495W5 492 aa16.52■□□□□ 0.23
CNGA3-205ENST00000436404 ZFP69Q49AA0 526 aa16.52■□□□□ 0.23
CNGA3-205ENST00000436404 SNAP47Q5SQN1 464 aa16.52■□□□□ 0.23
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF470Q6ECI4 717 aa16.52■□□□□ 0.23
CNGA3-205ENST00000436404 MSANTD2Q6P1R3 559 aa16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms