RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.66□□□□□ -0.06
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TOP3B-206ENST00000436282 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.66□□□□□ -0.06
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TOP3B-206ENST00000436282 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.65□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 SVOPQ8N4V2 548 aa14.65□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 METTL6Q8TCB7 284 aa14.65□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 GTF2H4Q92759 462 aa14.65□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 TPK1Q9H3S4 243 aa14.65□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 IKZF5Q9H5V7 419 aa14.65□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 SCN3BQ9NY72 215 aa14.65□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 OSGIN1Q9UJX0 560 aa14.65□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa14.65□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 PTPRDP23468 1912 aa14.65□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 GJB3O75712 270 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 EPOP01588 193 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 GSNP06396 782 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 RCVRNP35243 200 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 NRIP1P48552 1158 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 FCGRTP55899 365 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 TBX4P57082 545 aa14.64□□□□□ -0.07
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TOP3B-206ENST00000436282 DGCR6Q14129 220 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.074e-30■■■■■ 52.9
TOP3B-206ENST00000436282 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ALFQ53S48 1182 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 GPR149Q86SP6 731 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 C17orf50Q8WW18 174 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SH3GL1Q99961 368 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ZBBXA8MT70 800 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFS3O75489 264 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 TSPAN12O95859 305 aa14.64□□□□□ -0.07
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