RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 STARD8Q92502 1023 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 RFKQ969G6 155 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 HVCN1Q96D96 273 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CALML4Q96GE6 196 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 WDR24Q96S15 920 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CHST11Q9NPF2 352 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 FZD3Q9NPG1 666 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF446Q9NWS9 450 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 RNF14Q9UBS8 474 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PQM1 296 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 FAM92AA1XBS5 289 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TTC34A8MYJ7 566 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 C10orf142B7Z368 130 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 LMO7DNF2Z398 122 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 GRID2O43424 1007 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TACC1O75410 805 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 LATS1O95835 1130 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 FAM163BP0C2L3 166 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CCL4P13236 92 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CTSEP14091 401 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 DRD4P21917 467 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 MAN1A1P33908 653 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 KRT9P35527 623 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 RABIFP47224 123 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 THOP1P52888 689 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ART1P52961 327 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TNNC1P63316 161 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 UBXN1Q04323 297 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 GPS2Q13227 327 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ERV3-1Q14264 604 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 FZD2Q14332 565 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 PIM3Q86V86 326 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 PBKQ96KB5 322 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TNIP3Q96KP6 325 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CARD6Q9BX69 1037 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 DYRK4Q9NR20 520 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 EXOC1Q9NV70 894 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM30AQ9NV96 361 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 LUZP4Q9P127 313 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD63C9JTQ0 380 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 E7ENX8 843 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 FPGTO14772 594 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 KRT86O43790 486 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 DPM1O60762 260 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ALPIP09923 528 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 PLA2G4BP0C869 781 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 PRR35P0CG20 571 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 PCSK6P29122 969 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CD70P32970 193 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.424e-7■■■■■ 36.8
PTPRK-211ENST00000429595 DRD3P35462 400 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CSKP41240 450 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 STAT1P42224 750 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 PGFP49763 221 aa6.18□□□□□ -1.42
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