RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428863.6

MDM2-215, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 1,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MDM2-215ENST00000428863 TBC1D21Q8IYX1 336 aa14.63□□□□□ -0.07
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MDM2-215ENST00000428863 OR4L1Q8NH43 312 aa14.63□□□□□ -0.07
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