RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 TMPRSS3P57727 454 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 PRAMEP78395 509 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 MPP1Q00013 466 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 ABRQ12979 859 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 CALCOCO2Q13137 446 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 PRKG2Q13237 762 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 SQSTM1Q13501 440 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 MORF4L2Q15014 288 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 GPR33Q49SQ1 333 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 MSS51Q4VC12 460 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 SYTL3Q4VX76 610 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 ARMC3Q5W041 872 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 LRRC8BQ6P9F7 803 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 MREGQ8N565 214 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 NAT8LQ8N9F0 302 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 PHC3Q8NDX5 983 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 MCUQ8NE86 351 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 OR4L1Q8NH43 312 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 SLC30A3Q99726 388 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 CCM2Q9BSQ5 444 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 P2RY12Q9H244 342 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 SLC39A1Q9NY26 324 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 GALPQ9UBC7 116 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 SOX13Q9UN79 622 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 CDYLQ9Y232 598 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 NFS1Q9Y697 457 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 GSAPA4D1B5 854 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 B4E171 279 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 HCRTR1O43613 425 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 STK17BO94768 372 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 RALBP11234 206 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 FOLR1P15328 257 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 TSPAN7P41732 249 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 NSG1P42857 185 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 SLC1A2P43004 574 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 PGGT1BP53609 377 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 FOXM1Q08050 763 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 TRADDQ15628 312 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 GPR19Q15760 415 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 TYSND1Q2T9J0 566 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 PCID2Q5JVF3 399 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 FAM69BQ5VUD6 431 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 OOSP2Q86WS3 158 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 DENND6AQ8IWF6 608 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 AVL9Q8NBF6 648 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 LPGAT1Q92604 370 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 TTC9Q92623 222 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 SH3KBP1Q96B97 665 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 OR6C1Q96RD1 312 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 MENTQ9BUN1 341 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 DDA1Q9BW61 102 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 IL22Q9GZX6 179 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 ANAPC5Q9UJX4 755 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 POMT2Q9UKY4 750 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 SNX24Q9Y343 169 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 TLCD2A6NGC4 264 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 STMND1H3BQB6 276 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 K7ENP7 123 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 AP3B1O00203 1094 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 NVLO15381 856 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 KIAA0754O94854 1291 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 AP2A2O94973 939 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 VAPBO95292 243 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 MYBL2P10244 700 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 MLNP12872 115 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 ST6GAL1P15907 406 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 F8A1P23610 371 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 PSMB5P28074 263 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 ACADLP28330 430 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-216ENST00000428482 FOXL2P58012 376 aa9.93□□□□□ -0.82
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