RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424993.1

SNX18P3-201, Transcript of sorting nexin 18 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene SNX18P3, Length 835 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18P3-201ENST00000424993 SLC29A2Q14542 456 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 NR0B2Q15466 257 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 C14orf28Q4W4Y0 310 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 GPR155Q7Z3F1 870 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 CCDC91Q7Z6B0 441 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 PIM3Q86V86 326 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 TDRPQ86YL5 185 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 ZNF843Q8N446 348 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 PPM1NQ8N819 430 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 ARL10Q8N8L6 244 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 GPATCH11Q8N954 259 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 CFAP61Q8NHU2 1237 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 IFI44Q8TCB0 444 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 SLC37A2Q8TED4 501 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 ZFPM2Q8WW38 1151 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 SLC44A1Q8WWI5 657 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 ANKRD7Q92527 254 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 KCNJ9Q92806 393 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 ZBTB9Q96C00 473 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 RMDN2Q96LZ7 410 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 C12orf66Q96MD2 445 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 PANX3Q96QZ0 392 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 CCDC77Q9BR77 488 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 TMEM109Q9BVC6 243 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 TSSK1BQ9BXA7 367 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 POPDC3Q9HBV1 291 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 LRIT1Q9P2V4 623 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 CIDEBQ9UHD4 219 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 GNPTGQ9UJJ9 305 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 ACSL5Q9ULC5 683 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 CDYLQ9Y232 598 aa7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SNX18P3-201ENST00000424993 UNC13CQ8NB66 2214 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 CCDC189A1A4V9 331 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 KRT87PA6NCN2 255 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 OR5K4A6NMS3 321 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 E5RI56 91 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 GPC4O75487 556 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 SLCO2B1O94956 709 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 CKMT1AP12532 417 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 ALDH4A1P30038 563 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 GP5P40197 560 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 SLC26A3P40879 764 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 CD151P48509 253 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 ACADVLP49748 655 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 SERPINB9P50453 376 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 CSRP3P50461 194 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 CLCN7P51798 805 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 OR1D5P58170 312 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 CCL7P80098 99 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 HHEXQ03014 270 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 CFHR1Q03591 330 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 PRKG2Q13237 762 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 BIRC2Q13490 618 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 GBX1Q14549 363 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 ZNF460Q14592 562 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 RPE65Q16518 533 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 AMZ1Q400G9 498 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 SYTL3Q4VX76 610 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 LGSNQ5TDP6 509 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 HECTD2Q5U5R9 776 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 AGAP9Q5VTM2 703 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 NKAIN2Q5VXU1 208 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 UGT3A1Q6NUS8 523 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 CROCCP2Q86T23 111 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 SLC9B2Q86UD5 537 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 IQCKQ8N0W5 287 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 SFRP1Q8N474 314 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 HM13Q8TCT9 377 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 MAPK15Q8TD08 544 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX18P3-201ENST00000424993 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms