RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420234.5

PUM2-205, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-205	ENST00000420234	POU6F1	Q14863	301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	IRF4	Q15306	451 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CNGA3	Q16281	694 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	KLHL35	Q6PF15	583 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234		Q6ZSR6	202 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	DEFB119	Q8N690	84 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	OR4L1	Q8NH43	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	DIO2	Q92813	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	GLYATL1	Q969I3	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	VPS39	Q96JC1	886 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TRIB3	Q96RU7	358 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	EDEM2	Q9BV94	578 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	KIFC1	Q9BW19	673 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CLPB	Q9H078	707 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PRSS38	A1L453	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	C7orf72	A4D263	438 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234		A8MX80	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	MATN2	O00339	956 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	AQP9	O43315	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	RAD51C	O43502	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	AKAP10	O43572	662 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CDK14	O94921	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CSF2	P04141	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	APOA4	P06727	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	C1S	P09871	688 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PNLIP	P16233	465 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ENG	P17813	658 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	BCKDHB	P21953	392 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	IDS	P22304	550 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ACRV1	P26436	265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CNTF	P26441	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	POLD2	P49005	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	RGS4	P49798	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms