RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419504.5

TNS1-205, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-205ENST00000419504 AIREO43918 545 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 CCR8P51685 355 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 COX18Q8N8Q8 333 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 NAT14Q8WUY8 206 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 DNAJB4Q9UDY4 337 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 C8AP07357 584 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 CDH1P12830 882 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 SPIN4Q56A73 249 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 ITM2CQ9NQX7 267 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 HCN3Q9P1Z3 774 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 PFDN2Q9UHV9 154 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 UBR1Q8IWV7 1749 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 ILVBLA1L0T0 632 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 PRAMEF12O95522 483 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 CSKP41240 450 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 NUP54Q7Z3B4 507 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 AMZ2Q86W34 360 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 SIX5Q8N196 739 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 AVL9Q8NBF6 648 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 ZNF570Q96NI8 536 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 SLC38A3Q99624 504 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 LRRC3Q9BY71 257 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 USP29Q9HBJ7 922 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 UNCXA6NJT0 531 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 AQP12BA6NM10 295 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 A8MUI8 341 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 HOXC12P31275 282 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 CLCN4P51793 760 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 FOXM1Q08050 763 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 SWI5Q1ZZU3 235 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 AKIRIN2Q53H80 203 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 AQP12AQ8IXF9 295 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 IFT172Q9UG01 1749 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 A0A1W2PRG6 482 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 YJEFN3A6XGL0 299 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 AGRPO00253 132 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 RGS20O76081 388 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 PRPS1L1P21108 318 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 GDF10P55107 478 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 RPL26P61254 145 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 LIN52Q52LA3 116 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 CLEC20AQ6ZU45 233 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 PIGWQ7Z7B1 504 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 PSKH2Q96QS6 385 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 EFCAB11Q9BUY7 163 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 OXSMQ9NWU1 459 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 ARL5AQ9Y689 179 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 ANXA8P13928 327 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 SLC18A1P54219 525 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 PCDH1Q08174 1060 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 NUDT13Q86X67 352 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 NAT8LQ8N9F0 302 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 SNX10Q9Y5X0 201 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 TEX46H3BTG2 121 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 RENP00797 406 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 MPIP34949 423 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 WASP42768 502 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 PDX1P52945 283 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 SOWAHAQ2M3V2 549 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 SPATS1Q496A3 300 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 OR52J3Q8NH60 311 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 ACOT12Q8WYK0 555 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 TOP1MTQ969P6 601 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 C12orf66Q96MD2 445 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 SLC29A3Q9BZD2 475 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 ABCB8Q9NUT2 735 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 WNT9AO14904 365 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 FFAR2O15552 330 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 ALDH3A2P51648 485 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 NFKB2Q00653 900 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 E2F2Q14209 437 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 ZFP69Q49AA0 526 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 PAMR1Q6UXH9 720 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 QSOX2Q6ZRP7 698 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 HPS1Q92902 700 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 SUSD3Q96L08 255 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 TMEM209Q96SK2 561 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 C11orf16Q9NQ32 467 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 TESMINQ9Y4I5 508 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 ATRNL1Q5VV63 1379 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 MON2Q7Z3U7 1717 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 IQCF5A8MTL0 148 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 PCDH7O60245 1069 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 ZNF823P16415 610 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-205ENST00000419504 SEC13P55735 322 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms