RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM150AQ86TG1 271 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-206ENST00000414253 PIANPQ8IYJ0 282 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-206ENST00000414253 CARNMT1Q8N4J0 409 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-206ENST00000414253 EFHBQ8N7U6 833 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF555Q8NEP9 628 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC115Q96NT0 180 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-206ENST00000414253 MBOAT4Q96T53 435 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-206ENST00000414253 OSBPL10Q9BXB5 764 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-206ENST00000414253 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-206ENST00000414253 DNAJB9Q9UBS3 223 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-206ENST00000414253 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-206ENST00000414253 H0Y626 953 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 PPP3CCP48454 512 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 HK3P52790 923 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 AQP6Q13520 282 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 CYP2A13Q16696 494 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 MEP1AQ16819 746 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 PTPRNQ16849 979 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 NCEH1Q6PIU2 408 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 PJA1Q8NG27 643 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 OR8J3Q8NGG0 315 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 MUL1Q969V5 352 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF583Q96ND8 569 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 SLC22A12Q96S37 553 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 ACTL8Q9H568 366 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 GORASP2Q9H8Y8 452 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 SMURF2Q9HAU4 748 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 ASB1Q9Y576 335 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 PRRG1O14668 218 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 MC4RP32245 332 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 OPRL1P41146 370 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF783Q6ZMS7 281 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 FKBP9P1Q75LS8 142 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC138Q96M89 665 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM165Q9HC07 324 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 BPIFA1Q9NP55 256 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 USE1Q9NZ43 259 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 LHX3Q9UBR4 397 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 TSPAN12O95859 305 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 G6PDP11413 515 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 IDUAP35475 653 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 ERVPABLB-1P60509 514 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 PPP2R2BQ00005 443 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 TLE2Q04725 743 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 CYP20A1Q6UW02 462 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 GPSM1Q86YR5 675 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 FAM86B1Q8N7N1 296 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 OR52B6Q8NGF0 335 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM169Q96HH4 297 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 CD274Q9NZQ7 290 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 ENPP5Q9UJA9 477 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 BAG5Q9UL15 447 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 CLDN25C9JDP6 229 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 DNAJB5O75953 348 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 JAK1P23458 1154 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 PIGAP37287 484 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 IST1P53990 364 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF846Q147U1 533 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 TRIM16LQ309B1 348 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 TRIM60Q495X7 471 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 PARP8Q8N3A8 854 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 SVOPLQ8N434 492 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 TTC30BQ8N4P2 665 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 CDK15Q96Q40 435 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 LTB4R2Q9NPC1 389 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 A0A0U1RQS6 177 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 STX7O15400 261 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 OR1I1O60431 355 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 VPS26AO75436 327 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 CST1P01037 141 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 HTR1BP28222 390 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 DGKQP52824 942 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 RAB33AQ14088 237 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 LDLRAP1Q5SW96 308 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 LETMD1Q6P1Q0 360 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 NECAB2Q7Z6G3 386 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 SLC39A11Q8N1S5 342 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 FIG4Q92562 907 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 C17orf80Q9BSJ5 609 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-206ENST00000414253 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms