RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 SMPD4Q9NXE4 827 aa23.31■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 PPIL1Q9Y3C6 166 aa23.31■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 KATNA1O75449 491 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 HPRP00739 348 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 BPIP17213 487 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 HNF1BP35680 557 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 BMPR1AP36894 532 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 GNPDA1P46926 289 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 HSPA7P48741 367 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 CACHD1Q5VU97 1274 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 HTR3DQ70Z44 454 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 NXPE1Q8N323 547 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 SLC13A3Q8WWT9 602 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 USP7Q93009 1102 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 UGT2B28Q9BY64 529 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 OSBPL6Q9BZF3 934 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 KCTD5Q9NXV2 234 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 CRLS1Q9UJA2 301 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 PRRG1O14668 218 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 ULK1O75385 1050 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 FGF18O76093 207 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 GNAO1P09471 354 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 CNPP09543 421 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 SLC2A4P14672 509 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 GGT5P36269 586 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 NSG1P42857 185 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 MPPE1Q53F39 396 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 LPCAT2Q7L5N7 544 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 GPR141Q7Z602 305 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 ZNF786Q8N393 782 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 DTWD1Q8N5C7 304 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 TERB1Q8NA31 727 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 ZNF583Q96ND8 569 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 BOCQ9BWV1 1114 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 TRIM8Q9BZR9 551 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 WWOXQ9NZC7 414 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 SPG21Q9NZD8 308 aa23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 MYO7AQ13402 2215 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 GPR39O43194 453 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 EPB42P16452 691 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 SERPINA4P29622 427 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 TPGS1Q6ZTW0 290 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 TCAIMQ8N3R3 496 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 FIBINQ8TAL6 211 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 WFDC5Q8TCV5 224 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 GTF2H4Q92759 462 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 EGFL8Q99944 293 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 CERS4Q9HA82 394 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 IL21Q9HBE4 155 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 INSL5Q9Y5Q6 135 aa23.29■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 PRSS21Q9Y6M0 314 aa23.29■■□□□ 1.32
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PMS1-205ENST00000409985 APCDD1Q8J025 514 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 ITFG1Q8TB96 612 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 PPM1MQ96MI6 270 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 RNF145Q96MT1 663 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 TM6SF2Q9BZW4 377 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 CLMPQ9H6B4 373 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 PKD2L2Q9NZM6 624 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 CPQQ9Y646 472 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 A0A0U1RQS6 177 aa23.28■■□□□ 1.32
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PMS1-205ENST00000409985 K7ERQ8 282 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 TRIM16O95361 564 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 CLDN7O95471 211 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 IL1RNP18510 177 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 CTNNB1P35222 781 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 ALDH3A2P51648 485 aa23.28■■□□□ 1.32
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PMS1-205ENST00000409985 CHRNA6Q15825 494 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 GGTA1PQ4G0N0 100 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
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PMS1-205ENST00000409985 TMEM169Q96HH4 297 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 DPY30Q9C005 99 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa23.28■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 C5orf67F2Z3F1 127 aa23.27■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 MANBAO00462 879 aa23.27■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 SCELO95171 688 aa23.27■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 ANXA5P08758 320 aa23.27■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 SLC7A9P82251 487 aa23.27■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 CAMK1Q14012 370 aa23.27■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 MAPKAPK3Q16644 382 aa23.27■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 PHKG1Q16816 387 aa23.27■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa23.27■■□□□ 1.32
PMS1-205ENST00000409985 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa23.27■■□□□ 1.32
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