RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 SPARCL1Q14515 664 aa6.52□□□□□ -1.37
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CCL20-202ENST00000409189 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.52□□□□□ -1.37
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CCL20-202ENST00000409189 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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CCL20-202ENST00000409189 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.378e-7■□□□□ 11.1
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CCL20-202ENST00000409189 FEM1CQ96JP0 617 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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CCL20-202ENST00000409189 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 FICDQ9BVA6 458 aa6.51□□□□□ -1.37
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