RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399598.6

UBXN2B-201, Transcript of UBX domain protein 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN2B, Length 5,068 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2B-201ENST00000399598 NFATC1O95644 943 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 CLIP4Q8N3C7 705 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 HAPLN3Q96S86 360 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 A8MT66 165 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 SLC22A2O15244 555 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 TEX28O15482 410 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 MPZL2O60487 215 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 PRKCGP05129 697 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 ITGA3P26006 1051 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 GPX6P59796 221 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 PUDPQ08623 228 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 TYSND1Q2T9J0 566 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 PJA1Q8NG27 643 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 AKTIPQ9H8T0 292 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 CKLFQ9UBR5 152 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 RASGRP1O95267 797 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 GIMD1P0DJR0 217 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 ALAS2P22557 587 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 CCNFP41002 786 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 PRR5P85299 388 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 MSS51Q4VC12 460 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 TMEM110Q86TL2 294 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 LCN9Q8WX39 176 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 GPER1Q99527 375 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 OR51V1Q9H2C8 321 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 AKR1D1P51857 326 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 CCDC80Q76M96 950 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 C8orf48Q96LL4 319 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 MTRRQ9UBK8 725 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 TBX1O43435 398 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 FMO3P31513 532 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 IGFALSP35858 605 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 GGT5P36269 586 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 OGDHQ02218 1023 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 ATCAYQ86WG3 371 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 TMC8Q8IU68 726 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 TMEM165Q9HC07 324 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 FAM159BA6NKW6 160 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 AQP12BA6NM10 295 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 PPEF2O14830 753 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 DLX3O60479 287 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 DLG1Q12959 904 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 AQP12AQ8IXF9 295 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 PHC3Q8NDX5 983 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 RFKQ969G6 155 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 MRC1P22897 1456 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 URB1O60287 2271 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 M0R2N6 131 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 PGRP06401 933 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 CMPK1P30085 196 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 ARFIP1P53367 373 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 OR5K1Q8NHB7 308 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 ASB9Q96DX5 294 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 RNF39Q9H2S5 420 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 GALPQ9UBC7 116 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 SNX7Q9UNH6 387 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 A0A0G2JN53 185 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 SLC31A1O15431 190 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 FGF19O95750 216 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 PLD4Q96BZ4 506 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 LRRC58Q96CX6 371 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 GKN1Q9NS71 199 aa14.93□□□□□ -0.02
UBXN2B-201ENST00000399598 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms