RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.9□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 PDE10AQ9Y233 779 aa10.9□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 POMPQ9Y244 141 aa10.9□□□□□ -0.66
CTXN3-202ENST00000395322 MYO9BQ13459 2157 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 OR2AG2A6NM03 316 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 GFYI3L273 518 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 SLC28A1O00337 649 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 LCE2BO14633 110 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 CFLARO15519 480 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 LINC01565O15544 149 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 RGS14O43566 566 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 MTX2O75431 263 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 ANP32DO95626 131 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 STAMBPO95630 424 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 KRT6AP02538 564 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 CATP04040 527 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 KRT6BP04259 564 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 C6P13671 934 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 GNAZP19086 355 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 ME2P23368 584 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 GDI1P31150 447 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 GCKP35557 465 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 GPR1P46091 355 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 PSMD8P48556 350 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 KRT6CP48668 564 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 KCNK10P57789 538 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 MESP2Q0VG99 397 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 GRB7Q14451 532 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 GGTA1PQ4G0N0 100 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 BCL7AQ4VC05 210 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 PIGGQ5H8A4 983 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 RAET1GQ6H3X3 334 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 PAOXQ6QHF9 649 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 HPS6Q86YV9 775 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 FNDC5Q8NAU1 212 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 HMGCLL1Q8TB92 370 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 DLG3Q92796 817 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 CDK15Q96Q40 435 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 MYADMQ96S97 322 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 CDRT15Q96T59 188 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 FAM129BQ96TA1 746 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 NPAS2Q99743 824 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 GDF15Q99988 308 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 KXD1Q9BQD3 176 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 EPS15L1Q9UBC2 864 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 ITM2BQ9Y287 266 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 C15orf41Q9Y2V0 281 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 GPR45Q9Y5Y3 372 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 ST14Q9Y5Y6 855 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 CEP290O15078 2479 aa10.89□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 CHD7Q9P2D1 2997 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 NR5A2O00482 541 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 TRIM38O00635 465 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 SPINT1O43278 529 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 TSPAN6O43657 245 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 SGTAO43765 313 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 ULK1O75385 1050 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 CLDN9O95484 217 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 VHLP40337 213 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 PSME3P61289 254 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 EMX2Q04743 252 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 FOXM1Q08050 763 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 ADAM15Q13444 863 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 LRP8Q14114 963 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 FLOT2Q14254 428 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 NR6A1Q15406 480 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 MAP7D1Q3KQU3 841 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 SPATS1Q496A3 300 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 C6orf136Q5SQH8 315 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 ACOX2Q99424 681 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 ACTR8Q9H981 624 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 PRSS16Q9NQE7 514 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 HEBP1Q9NRV9 189 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 GID8Q9NWU2 228 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 CROTQ9UKG9 612 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 CHD9Q3L8U1 2897 aa10.88□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 RFXAPO00287 272 aa10.87□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 INPP4BO15327 924 aa10.87□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 AP1G1O43747 822 aa10.87□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 VEGFDO43915 354 aa10.87□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 TBX10O75333 385 aa10.87□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 SLC22A3O75751 556 aa10.87□□□□□ -0.67
CTXN3-202ENST00000395322 SLC19A1P41440 591 aa10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms