RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 OR8H2Q8N162 312 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 KCTD6Q8NC69 237 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 PPFIBP2Q8ND30 876 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 OR10V1Q8NGI7 309 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 FGFBP3Q8TAT2 258 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 NXNL1Q96CM4 212 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 MYADMQ96S97 322 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 RTP3Q9BQQ7 232 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 TAB2Q9NYJ8 693 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 COQ3Q9NZJ6 369 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 PLOD2O00469 737 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC01565O15544 149 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 LINGO3P0C6S8 592 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 ERVK-10P10266 1014 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT20P35900 424 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 CCR3P51677 355 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 CDH11P55287 796 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 LGALS3BPQ08380 585 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 DMPKQ09013 629 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 HYAL1Q12794 435 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM266Q2M3C6 531 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 C9orf152Q5JTZ5 239 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 ERMARDQ5T6L9 678 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 C6orf163Q5TEZ5 329 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM198BQ6UWH4 519 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT74Q7RTS7 529 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF554Q86TJ5 538 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJC22Q8N4W6 341 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 TC2NQ8N9U0 490 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIML1Q8N9V2 468 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM58Q8NG06 486 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 OR1J1Q8NGS3 322 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 OR13J1Q8NGT2 312 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 GRHL3Q8TE85 626 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 TEKT4Q8WW24 435 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 HSD17B8Q92506 261 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 SPDL1Q96EA4 605 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 RHNO1Q9BSD3 238 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 TXLNGYQ9BZA5 131 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 ECHDC1Q9NTX5 307 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 ADPRHL2Q9NX46 363 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 B3GAT1Q9P2W7 334 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 OSGIN1Q9UJX0 560 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 MTUS1Q9ULD2 1270 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PPM1 405 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 MEIS2O14770 477 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDH7O60245 1069 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 PLOD3O60568 738 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 WDPCPO95876 746 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 PLGP00747 810 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 DNTTP04053 509 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 CFC1BP0CG36 223 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 CFC1P0CG37 223 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 MT3P25713 68 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC6A6P31641 620 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 CAPZA2P47755 286 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 TUBB4BP68371 445 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 CX3CL1P78423 397 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 HSPB3Q12988 150 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 LETM2Q2VYF4 491 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 CRY2Q49AN0 593 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL26Q53HC5 615 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 DCAF10Q5QP82 559 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGAP24Q8N264 748 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 IRGQQ8WZA9 623 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 SLAMF9Q96A28 289 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 F2RL3Q96RI0 385 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 A4GALTQ9NPC4 353 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 TXLNGQ9NUQ3 528 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 DPP3Q9NY33 737 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 LRWD1Q9UFC0 647 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 IL17BQ9UHF5 180 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 PADI2Q9Y2J8 665 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 TRBC2A0A5B9 178 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 UBE2CO00762 179 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 TADA2AO75478 443 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms