RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CERS6Q6ZMG9 384 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF534Q76KX8 674 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PCGF5Q86SE9 256 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R3BQ86XI6 285 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 KMT5CQ86Y97 462 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CREG2Q8IUH2 290 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CARFQ8N187 725 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ESX1Q8N693 406 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 OR4E2Q8NGC2 313 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 OR52E1Q8NGJ3 308 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 OR6P1Q8NGX9 317 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 LCN9Q8WX39 176 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ELMO1Q92556 727 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SLCO2A1Q92959 643 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PEX13Q92968 403 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 MED8Q96G25 268 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 MS4A14Q96JA4 679 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SLC45A3Q96JT2 553 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TTC1Q99614 292 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 MAP3K3Q99759 626 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 HGH1Q9BTY7 390 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 AP1M1Q9BXS5 423 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 IL22Q9GZX6 179 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SRMSQ9H3Y6 488 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 MVB12BQ9H7P6 319 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SEMA5BQ9P283 1151 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PCYOX1Q9UHG3 505 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 POMT2Q9UKY4 750 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS21Q9Y6M0 314 aa7.45□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 OR1I1O60431 355 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SPAG6O75602 509 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TIAF1O95411 115 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 KRT14P02533 472 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 FAM87AP0C7U9 286 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PRKAR1AP10644 381 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 MLNP12872 115 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 FOLR1P15328 257 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CDH3P22223 829 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 TTPAP49638 278 aa7.44□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 DR1Q01658 176 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ACY1Q03154 408 aa7.44□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 LINC00303Q3SY05 128 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PCID2Q5JVF3 399 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.44□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 SYT10Q6XYQ8 523 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 HOOK3Q86VS8 718 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 D2HGDHQ8N465 521 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 EXD3Q8N9H8 876 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PHC3Q8NDX5 983 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 OR5AR1Q8NGP9 310 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 KIF18AQ8NI77 898 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 STARD8Q92502 1023 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SGSM3Q96HU1 749 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CAPZA3Q96KX2 299 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 NRTNQ99748 197 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 EFHD1Q9BUP0 239 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TSSK1BQ9BXA7 367 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CHRAC1Q9NRG0 131 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 FGF21Q9NSA1 209 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 BFARQ9NZS9 450 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ASIC3Q9UHC3 531 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 IL17BQ9UHF5 180 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 RARRES3Q9UL19 164 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ASF1AQ9Y294 204 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 BTRCQ9Y297 605 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 RELNP78509 3460 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 FER1L5A0AVI2 2057 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SPTBP11277 2137 aa7.43□□□□□ -1.22
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