RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353284.7

PTPRS-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-202ENST00000353284 CYP4F8P98187 520 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 ARHGAP1Q07960 439 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 GRB7Q14451 532 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 ZNF678Q5SXM1 525 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 CRTC1Q6UUV9 634 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 DEFB128Q7Z7B8 93 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 KCNS3Q9BQ31 491 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 OSBPL2Q9H1P3 480 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 TBCCD1Q9NVR7 557 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 PEX16Q9Y5Y5 336 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 NUP98P52948 1817 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 K7EPI3 171 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 C8BP07358 591 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 NR2F1P10589 423 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 G6PDP11413 515 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 TNNI3P19429 210 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 ACADVLP49748 655 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 CDKL1Q00532 357 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 NOGQ13253 232 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 CYP2A13Q16696 494 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 PRR23BQ6ZRT6 265 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 SERPINA9Q86WD7 417 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 CILP2Q8IUL8 1156 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 PHACTR4Q8IZ21 702 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 KRT78Q8N1N4 520 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 ZBTB2Q8N680 514 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 C11orf65Q8NCR3 313 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 RTP4Q96DX8 246 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 SMOQ99835 787 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 STOML2Q9UJZ1 356 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 PADI3Q9ULW8 664 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 CHD4Q14839 1912 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 G3V2L1 256 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 CAPN15O75808 1086 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 AP2A2O94973 939 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 VARSP26640 1264 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 CENPAP49450 140 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 DNAJB13P59910 316 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 CACNG1Q06432 222 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 ALFQ53S48 1182 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 ANXA8L1Q5VT79 327 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 RGMBQ6NW40 437 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 C11orf88Q6PI97 169 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 ELMOD2Q8IZ81 293 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 GRPEL2Q8TAA5 225 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 KCTD13Q8WZ19 329 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 PPCDCQ96CD2 204 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 VRTNQ9H8Y1 702 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 ZNF304Q9HCX3 659 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 ZIM2Q9NZV7 527 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 RBPJLQ9UBG7 517 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 EDARQ9UNE0 448 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 CASKO14936 926 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 PTGER3P43115 390 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 FOXM1Q08050 763 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 MYBPC3Q14896 1274 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 TECRLQ5HYJ1 363 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 NANOGP8Q6NSW7 305 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 CACUL1Q86Y37 369 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 CLIP4Q8N3C7 705 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 ZNF671Q8TAW3 534 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 NANOGQ9H9S0 305 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 KCTD5Q9NXV2 234 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 METTL21EPA6NDL7 271 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 FFAR2O15552 330 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 XPNPEP2O43895 674 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 BMP10O95393 424 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 IFNGR2P38484 337 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 MAPK8P45983 427 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 MYBPC1Q00872 1141 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 CHIT1Q13231 466 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 KCNAB2Q13303 367 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 TIGD6Q17RP2 521 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 TYSND1Q2T9J0 566 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 CDK20Q8IZL9 346 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 PNPLA1Q8N8W4 532 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 KDM1BQ8NB78 822 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRS-202ENST00000353284 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms