RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 HS6ST1O60243 411 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 IL33O95760 270 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 BMP4P12644 408 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 EDN3P14138 238 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 SLC25A3Q00325 362 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 MAPKAPK3Q16644 382 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 CFAP161Q6P656 301 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 GPR149Q86SP6 731 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 LIX1Q8N485 282 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 CD101Q93033 1021 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 RADILQ96JH8 1075 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 SUSD3Q96L08 255 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 SYT11Q9BT88 431 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 FBXW11Q9UKB1 542 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 RAB23Q9ULC3 237 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 OBSL1O75147 1896 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 EFCAB10A6NFE3 127 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 TARM1B6A8C7 271 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 TBC1D4O60343 1298 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 UPK1BO75841 260 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 ABHD2P08910 425 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 TRIM49P0CI25 452 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 TRIM49CP0CI26 452 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 ACADMP11310 421 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 IL7P13232 177 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 SPNP16150 400 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 BGNP21810 368 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 MATN1P21941 496 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 LMO2P25791 158 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 FNTBP49356 437 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 PPP5CP53041 499 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 GRIK2Q13002 908 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 KCNJ11Q14654 390 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 LINC00523Q86TU6 105 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 C12orf40Q86WS4 652 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 LILRA2Q8N149 483 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 GPD1LQ8N335 351 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 POC5Q8NA72 575 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 FGF14Q92915 247 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 SGTBQ96EQ0 304 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 ZSWIM3Q96MP5 696 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 AGPAT1Q99943 283 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 PI4K2AQ9BTU6 479 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 UCK2Q9BZX2 261 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 GPR88Q9GZN0 384 aa7.12□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 A8MVJ9 347 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 CYB561D2O14569 222 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 RGS5O15539 181 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 IL1BP01584 269 aa7.11□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 TIMP2P16035 220 aa7.11□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 CES5AQ6NT32 575 aa7.11□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 UBQLNLQ8IYU4 475 aa7.11□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 ZNF527Q8NB42 609 aa7.11□□□□□ -1.27
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CCR6-202ENST00000349984 KLHL15Q96M94 604 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 BBS4Q96RK4 519 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 BDH2Q9BUT1 245 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 SCML1Q9UN30 329 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCR6-202ENST00000349984 COL4A2P08572 1712 aa7.11□□□□□ -1.27
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