RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 NT5EP21589 574 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 IL4RP24394 825 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PLK1P53350 603 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TMPRSS3P57727 454 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ARF5P84085 180 aa4.34□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 ABHD18Q0P651 414 aa4.34□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 CHSY3Q70JA7 882 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM73Q86UV7 250 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PLD3Q8IV08 490 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TRAM1L1Q8N609 369 aa4.34□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC39A13Q96H72 371 aa4.34□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 LPAR4Q99677 370 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 HDAC8Q9BY41 377 aa4.34□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 RMI1Q9H9A7 625 aa4.34□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa4.34□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 HHLA1C9JL84 531 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 KRT6AP02538 564 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 KRT6BP04259 564 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF24P17028 368 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 FBLP22087 321 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 COILP38432 576 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 KRT6CP48668 564 aa4.34□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 RAB8AP61006 207 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 AP2B1P63010 937 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CHAF1BQ13112 559 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PDPK2PQ6A1A2 396 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 UNC5AQ6ZN44 842 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 FAM47EQ6ZV65 393 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 HOMEZQ8IX15 550 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 EID3Q8N140 333 aa4.34□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC37A2Q8TED4 501 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 DTD2Q96FN9 168 aa4.34□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 KCTD3Q9Y597 815 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC162PA2VCL2 907 aa4.34□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 SIRPB2Q5JXA9 342 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ACSM2BQ68CK6 577 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SUSD1Q6UWL2 747 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM26Q6ZUK4 368 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 RRM2BQ7LG56 351 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM150AQ86TG1 271 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PRUNE1Q86TP1 453 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 HORMAD2Q8N7B1 307 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PRELID2Q8N945 189 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 GALNT6Q8NCL4 622 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 VPS37AQ8NEZ2 397 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 OR52K2Q8NGK3 314 aa4.34□□□□□ -1.71
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