RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 EMBQ6PCB8 327 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 UNC5DQ6UXZ4 953 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D21Q8IYX1 336 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 OR10G6Q8NH81 332 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 OR5K2Q8NHB8 316 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 SLC44A1Q8WWI5 657 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 RAB21Q9UL25 225 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 KNTC1P50748 2209 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 RPN2P04844 631 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 TUBBP07437 444 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 TYRP1P17643 537 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 MSH2P43246 934 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 EPHA4P54764 986 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CLDN6P56747 220 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 SPIDRQ14159 915 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 MROH9Q5TGP6 573 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 USP53Q70EK8 1073 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CEP97Q8IW35 865 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 ZFPM2Q8WW38 1151 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 LINGO1Q96FE5 620 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 TSPAN17Q96FV3 270 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 RDH14Q9HBH5 336 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 DUX1O43812 170 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 UBXN7O94888 489 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 MPC1LP0DKB6 136 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 AMD1P17707 334 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CD1CP29017 333 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 IL2P60568 153 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 GPLD1P80108 840 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 BMPR2Q13873 1038 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 MAP9Q49MG5 647 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 NEK10Q6ZWH5 1172 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 OR52E1Q8NGJ3 308 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 WDR48Q8TAF3 677 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 GPAMQ9HCL2 828 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 POLG2Q9UHN1 485 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 MATN4O95460 622 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 STMN1P16949 149 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 BDKRB1P46663 353 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 HES3Q5TGS1 186 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 TTC23LQ6PF05 361 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 MYO1HQ8N1T3 1032 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 LCN9Q8WX39 176 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC77Q9BR77 488 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CIDEBQ9UHD4 219 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 PROS1P07225 676 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 HSD17B3P37058 310 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM207Q6UWW9 146 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CYHR1Q6ZMK1 362 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 TAOK1Q7L7X3 1001 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 OR4E2Q8NGC2 313 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 NCSTNQ92542 709 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CAVIN3Q969G5 261 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 POPDC3Q9HBV1 291 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 SYTL2Q9HCH5 934 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 PLAGL1Q9UM63 463 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 PCM1Q15154 2024 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 KIF26BQ2KJY2 2108 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 TCEA3O75764 348 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 C1orf105O95561 183 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CPNE6O95741 557 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 SERPINB9P50453 376 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 RAB10P61026 200 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 FOXC1Q12948 553 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 RAPH1Q70E73 1250 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CMC1Q7Z7K0 106 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 DCAKDQ8WVC6 231 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 RSC1A1Q92681 617 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 NRTNQ99748 197 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 NUDT22Q9BRQ3 303 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 SRMSQ9H3Y6 488 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 EPB41L1Q9H4G0 881 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 XKR8Q9H6D3 395 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 HMX2A2RU54 273 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 D6RAR5 112 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 KDM1AO60341 852 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 TSPAN12O95859 305 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CATP04040 527 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 SHBGP04278 402 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CSF2RBP32927 897 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 CCNFP41002 786 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 KLHL35Q6PF15 583 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD4-201ENST00000306324 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms