RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277010.8

SIGMAR1-201, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-201ENST00000277010 LINGO1Q96FE5 620 aa22.21■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 NRTNQ99748 197 aa22.21■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 LRRN3Q9H3W5 708 aa22.21■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 MATN4O95460 622 aa22.2■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 SHBGP04278 402 aa22.2■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 GCAP28676 217 aa22.2■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 RGS4P49798 205 aa22.2■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 E2F1Q01094 437 aa22.2■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 UNC5DQ6UXZ4 953 aa22.2■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 CYHR1Q6ZMK1 362 aa22.2■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 NEK10Q6ZWH5 1172 aa22.2■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 DCAKDQ8WVC6 231 aa22.2■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 FOPNLQ96NB1 174 aa22.2■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 CIDEBQ9UHD4 219 aa22.2■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 ASXL3Q9C0F0 2248 aa22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 SPTBN4Q9H254 2564 aa22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 TSPAN12O95859 305 aa22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 STMN1P16949 149 aa22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 TYRP1P17643 537 aa22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CD1CP29017 333 aa22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 BDKRB1P46663 353 aa22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 IL2P60568 153 aa22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP53Q70EK8 1073 aa22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CMC1Q7Z7K0 106 aa22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR52E1Q8NGJ3 308 aa22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZFPM2Q8WW38 1151 aa22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 TSPAN17Q96FV3 270 aa22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 RDH14Q9HBH5 336 aa22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 GPAMQ9HCL2 828 aa22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZW10O43264 779 aa22.19■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 UBXN7O94888 489 aa22.19■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 C1orf105O95561 183 aa22.19■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 MPC1LP0DKB6 136 aa22.19■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 EPHA4P54764 986 aa22.19■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa22.19■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR10G6Q8NH81 332 aa22.19■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.19■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 POPDC3Q9HBV1 291 aa22.19■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 PLAGL1Q9UM63 463 aa22.19■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 RP1P56715 2156 aa22.19■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 KRT87PA6NCN2 255 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 RPN2P04844 631 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CDK4P11802 303 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 RAB10P61026 200 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 GPLD1P80108 840 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 MYO1HQ8N1T3 1032 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 ANKRD49Q8WVL7 239 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 ASB11Q8WXH4 323 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 RSC1A1Q92681 617 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CCDC77Q9BR77 488 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 XKR8Q9H6D3 395 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 OGFRQ9NZT2 677 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 POLG2Q9UHN1 485 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF180Q9UJW8 692 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 TPBGLP0DKB5 382 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 AMD1P17707 334 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 GMPRP36959 345 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 SERPINB9P50453 376 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 SPIDRQ14159 915 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 MAP9Q49MG5 647 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CCSMST1Q4G0I0 132 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 RAPH1Q70E73 1250 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR4E2Q8NGC2 313 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 LCN9Q8WX39 176 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 NCSTNQ92542 709 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 NUDT22Q9BRQ3 303 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZMYND15Q9H091 742 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 SYTL2Q9HCH5 934 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 ARHGEF33A8MVX0 844 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 DUX1O43812 170 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 PROS1P07225 676 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CSF2RBP32927 897 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CFHR1Q03591 330 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 HES3Q5TGS1 186 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 TAOK1Q7L7X3 1001 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 KRT38O76015 456 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CPNE6O95741 557 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CATP04040 527 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 GRB7Q14451 532 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 TTC23LQ6PF05 361 aa22.16■■□□□ 1.14
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