RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ABRQ12979 859 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 GRB7Q14451 532 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 SNAP47Q5SQN1 464 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 OTOAQ7RTW8 1153 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 GALNT7Q86SF2 657 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 PROSER1Q86XN7 944 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D21Q8IYX1 336 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 OR4E2Q8NGC2 313 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 TGM7Q96PF1 710 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 CMKLR1Q99788 373 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 PHACTR1Q9C0D0 580 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 SMYD2Q9NRG4 433 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 OCIAD1Q9NX40 245 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 KLHL3Q9UH77 587 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 OR6C74A6NCV1 312 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 BTN3A3O00478 584 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 KPNA5O15131 536 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 C1QAP02745 245 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 GPX6P59796 221 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 KRT33BQ14525 404 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 PLCL1Q15111 1095 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 ACSBG2Q5FVE4 666 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 FOXR1Q6PIV2 292 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0408Q6ZU52 694 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 BMPERQ8N8U9 685 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 GSDMBQ8TAX9 411 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 PYROXD1Q8WU10 500 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 KCNJ9Q92806 393 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 HGH1Q9BTY7 390 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 MENTQ9BUN1 341 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 XKR8Q9H6D3 395 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 HRASLS2Q9NWW9 162 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 NFS1Q9Y697 457 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 EPG5Q9HCE0 2579 aa21.66■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 URB1O60287 2271 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 TNFSF15O95150 251 aa21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD34CP0C6C1 535 aa21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 SSTR1P30872 391 aa21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 ABCG1P45844 678 aa21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D25Q3MII6 688 aa21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 LSMEM2Q8N112 164 aa21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 LCN9Q8WX39 176 aa21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 KLHL42Q9P2K6 505 aa21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 ICKQ9UPZ9 632 aa21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 DHRS7Q9Y394 339 aa21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 PSAT1Q9Y617 370 aa21.65■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 MATN4O95460 622 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 ITGA2BP08514 1039 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 MGAT5Q09328 741 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 TMED2Q15363 201 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 FAM92BQ6ZTR7 304 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 PRSS42Q7Z5A4 293 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CLEC14AQ86T13 490 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB2Q8N680 514 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CEP112Q8N8E3 955 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 LRRN4CLQ8ND94 238 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 AGBL5Q8NDL9 886 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 KLHL6Q8WZ60 621 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 PMEPA1Q969W9 287 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 PPM1MQ96MI6 270 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 NDNQ99608 321 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 MCMBPQ9BTE3 642 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 PISDQ9UG56 409 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 POLG2Q9UHN1 485 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 COMMD10Q9Y6G5 202 aa21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 PIAS1O75925 651 aa21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 ATP5DP30049 168 aa21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 ECHS1P30084 290 aa21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 ERVPABLB-1P60509 514 aa21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 IRGCQ6NXR0 463 aa21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 KLHL35Q6PF15 583 aa21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 UNC5DQ6UXZ4 953 aa21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CYHR1Q6ZMK1 362 aa21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CYS1Q717R9 158 aa21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 AMIGO1Q86WK6 493 aa21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 OOSP2Q86WS3 158 aa21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CFAP61Q8NHU2 1237 aa21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CD200R1Q8TD46 325 aa21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC12Q96GR4 267 aa21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 GPR21Q99679 349 aa21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 MAP3K3Q99759 626 aa21.63■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 SRMSQ9H3Y6 488 aa21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms