RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 NPPAP01160 153 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TSPAN8P19075 237 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CCKBRP32239 447 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ATP4BP51164 291 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CLCN4P51793 760 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ERVK-8P63133 956 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 MPP1Q00013 466 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ZBTB6Q15916 424 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 MAPK14Q16539 360 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 COX18Q8N8Q8 333 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 BANPQ8N9N5 519 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 HERVK_113Q902F9 699 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TP53INP1Q96A56 240 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PHF12Q96QT6 1004 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 FZD8Q9H461 694 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SLC28A3Q9HAS3 691 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ERVK-5Q9HDB9 667 aa7.1□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 FAM25EA8MYX2 175 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TMEM150CB9EJG8 249 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 K7EPI3 171 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ITGA10O75578 1167 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GADD45GO95257 159 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TNFP01375 233 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PIRTP0C851 137 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ZNF12P17014 697 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 IMPDH1P20839 514 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CPN2P22792 545 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TUBA1BP68363 451 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ADGRE1Q14246 886 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TUBA1AQ71U36 451 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 HPS6Q86YV9 775 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CADM2Q8N3J6 435 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CCDC107Q8WV48 283 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TSSK3Q96PN8 268 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ACP6Q9NPH0 428 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 P2RX2Q9UBL9 471 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CIDEBQ9UHD4 219 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PLOD3O60568 738 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ZNF3P17036 446 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SCARB2Q14108 478 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 EOGTQ5NDL2 527 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PARGQ86W56 976 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CFAP206Q8IYR0 622 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 NAT16Q8N8M0 369 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SLC9A6Q92581 669 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CMTM7Q96FZ5 175 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SLC2A11Q9BYW1 496 aa7.1□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CD2P06729 351 aa7.09□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 MPIP34949 423 aa7.09□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 HSPA7P48741 367 aa7.09□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RORCP51449 518 aa7.09□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 E2F2Q14209 437 aa7.09□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 TMEM220Q6QAJ8 160 aa7.09□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 FRRS1Q6ZNA5 592 aa7.09□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RAB2BQ8WUD1 216 aa7.09□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 SLC38A3Q99624 504 aa7.09□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 CHRAC1Q9NRG0 131 aa7.09□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 DMAC2Q9NW81 257 aa7.09□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 NMBRP28336 390 aa7.09□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 MVKQ03426 396 aa7.09□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 SEMA3AQ14563 771 aa7.09□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GRIK5Q16478 980 aa7.09□□□□□ -1.27
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