RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 GZMAP12544 262 aa15.83■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 CA4P22748 312 aa15.83■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 AMPD1P23109 780 aa15.83■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 IL1R2P27930 398 aa15.83■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 PRKAA1Q13131 559 aa15.83■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 XRCC4Q13426 336 aa15.83■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 NINJ1Q92982 152 aa15.83■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 VPS35Q96QK1 796 aa15.83■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa15.83■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 GPAMQ9HCL2 828 aa15.83■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 CDC23Q9UJX2 597 aa15.83■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF835Q9Y2P0 537 aa15.83■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GTH6 734 aa15.82■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 HCRTR1O43613 425 aa15.82■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 PRPSAP2O60256 369 aa15.82■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 RNF8O76064 485 aa15.82■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 TUBB8Q3ZCM7 444 aa15.82■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 Q71RC1 249 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF653Q96CK0 615 aa15.82■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL25Q9H0H3 589 aa15.82■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 C2orf72A6NCS6 295 aa15.81■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 OR2B3O76000 313 aa15.81■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 GABRA4P48169 554 aa15.81■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 CTSCP53634 463 aa15.81■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 GTF2H3Q13889 308 aa15.81■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 DPYSL2Q16555 572 aa15.81■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 OR11G2Q8NGC1 345 aa15.81■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 OR4E2Q8NGC2 313 aa15.81■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 CPLX3Q8WVH0 158 aa15.81■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 MAML1Q92585 1016 aa15.81■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa15.8■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 ITGAXP20702 1163 aa15.8■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 KLHL30Q0D2K2 578 aa15.8■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB110Q30KQ9 67 aa15.8■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 POLNQ7Z5Q5 900 aa15.8■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 HAS2Q92819 552 aa15.8■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 FKBP10Q96AY3 582 aa15.8■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 SMR3AQ99954 134 aa15.8■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 BTN3A1O00481 513 aa15.79■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 MAP3K7O43318 606 aa15.79■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 SERPINB6P35237 376 aa15.79■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa15.79■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa15.79■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 PSMF1Q92530 271 aa15.79■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 ARSGQ96EG1 525 aa15.79■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 MAGED4Q96JG8 741 aa15.79■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 CSPG4P5Q96PW8 444 aa15.79■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 MESP1Q9BRJ9 268 aa15.79■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 WDR54Q9H977 334 aa15.79■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 TXLNGQ9NUQ3 528 aa15.79■□□□□ 0.12
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