RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 AXIN1O15169 862 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 NRP2O60462 931 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 UGDHO60701 494 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 CRCPO75575 148 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 SLCO2B1O94956 709 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 TRIM16O95361 564 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 PSMG1O95456 288 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 PRSS56P0CW18 603 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 ITGAXP20702 1163 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 PGGT1BP53609 377 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 FOXM1Q08050 763 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF284Q2VY69 593 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 TMEM52BQ4KMG9 183 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 FAM46CQ5VWP2 391 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 ZFP1Q6P2D0 407 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 Q6ZVU0 165 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 RASGRP3Q8IV61 690 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 DSELQ8IZU8 1212 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 GOLM1Q8NBJ4 401 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 PPFIBP2Q8ND30 876 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 DNAJB8Q8NHS0 232 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 GIMAP7Q8NHV1 300 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 MCOLN3Q8TDD5 553 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 TWIST2Q8WVJ9 160 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 ATL1Q8WXF7 558 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 ASB11Q8WXH4 323 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 OR8D1Q8WZ84 308 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 SLC30A3Q99726 388 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 HDAC8Q9BY41 377 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 SLC32A1Q9H598 525 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 AKTIPQ9H8T0 292 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 GID8Q9NWU2 228 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 EBF1Q9UH73 591 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 SLC7A8Q9UHI5 535 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 PPM1HQ9ULR3 514 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 GPR34Q9UPC5 381 aa10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 DCDC2BA2VCK2 349 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 K7EPI3 171 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 WNT9AO14904 365 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 KAT7O95251 611 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 C1SP09871 688 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 ACPPP15309 386 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 EPB42P16452 691 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 CYP2A7P20853 494 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 GPX3P22352 226 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 LHCGRP22888 699 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 ME2P23368 584 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 ITGB7P26010 798 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 GKP32189 559 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 RPIAP49247 311 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 HK3P52790 923 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 CDH13P55290 713 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 SLC25A3Q00325 362 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 EMX2Q04743 252 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 CUL3Q13618 768 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 GTF2H2Q13888 395 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 LRP8Q14114 963 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 LRRC32Q14392 662 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 AGERQ15109 404 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 RPS6KA2Q15349 733 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 PLK5Q496M5 336 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 ACSBG2Q5FVE4 666 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 C1orf146Q5VVC0 180 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 LIPIQ6XZB0 460 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 TRIM46Q7Z4K8 759 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 MILR1Q7Z6M3 343 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 TSPAN33Q86UF1 283 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 DEFB107AQ8IZN7 70 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 MIER2Q8N344 545 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 MINDY1Q8N5J2 469 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 DEFB119Q8N690 84 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 CHST14Q8NCH0 376 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 OR6K2Q8NGY2 324 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 AGR3Q8TD06 166 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 DLG3Q92796 817 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 RHBDF1Q96CC6 855 aa10.44□□□□□ -0.74
CDCA3-201ENST00000229265 PPP3R2Q96LZ3 170 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms