RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 SFRP1Q8N474 314 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 P2RY13Q9BPV8 354 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 PRSS16Q9NQE7 514 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 RNF11Q9Y3C5 154 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM202A6NGA9 273 aa23.41■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 E7ENX8 843 aa23.41■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 NVLO15381 856 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 RGS14O43566 566 aa23.41■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 ULK1O75385 1050 aa23.41■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 WDR47O94967 919 aa23.41■■□□□ 1.34
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RPUSD1-201ENST00000007264 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 TAF11Q15544 211 aa23.41■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM46CQ5VWP2 391 aa23.41■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa23.41■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa23.41■■□□□ 1.34
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RPUSD1-201ENST00000007264 C9JVG2 144 aa23.4■■□□□ 1.34
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RPUSD1-201ENST00000007264 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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RPUSD1-201ENST00000007264 ABRQ12979 859 aa23.4■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 AP5B1Q2VPB7 878 aa23.4■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 MAP7D1Q3KQU3 841 aa23.4■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa23.4■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 PARM1Q6UWI2 310 aa23.4■■□□□ 1.34
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RPUSD1-201ENST00000007264 GLMNQ92990 594 aa23.4■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 SPDL1Q96EA4 605 aa23.4■■□□□ 1.34
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RPUSD1-201ENST00000007264 EMX2Q04743 252 aa23.4■■□□□ 1.34
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RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM52BQ4KMG9 183 aa23.4■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 DENND4AQ7Z401 1863 aa23.4■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 FGF14Q92915 247 aa23.4■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 RAB7BQ96AH8 199 aa23.4■■□□□ 1.34
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RPUSD1-201ENST00000007264 GID8Q9NWU2 228 aa23.4■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 ZIM2Q9NZV7 527 aa23.4■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 P2RY2P41231 377 aa23.39■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 PTCHD3Q3KNS1 767 aa23.39■■□□□ 1.34
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RPUSD1-201ENST00000007264 RETREG3Q86VR2 466 aa23.39■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 HDAC8Q9BY41 377 aa23.39■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 EPHX3Q9H6B9 360 aa23.39■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 NMRK1Q9NWW6 199 aa23.39■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 EPS15L1Q9UBC2 864 aa23.39■■□□□ 1.34
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RPUSD1-201ENST00000007264 PREPP48147 710 aa23.39■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 KRT6CP48668 564 aa23.39■■□□□ 1.33
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RPUSD1-201ENST00000007264 COQ5Q5HYK3 327 aa23.39■■□□□ 1.33
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RPUSD1-201ENST00000007264 CHPFQ8IZ52 775 aa23.39■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 PYCR2Q96C36 320 aa23.39■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 FOPNLQ96NB1 174 aa23.39■■□□□ 1.33
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RPUSD1-201ENST00000007264 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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RPUSD1-201ENST00000007264 ASB9Q96DX5 294 aa23.38■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
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RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM45AQ9NWC5 275 aa23.38■■□□□ 1.33
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