RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	TTC16	Q8NEE8	873 aa		15.07	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		15.07	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		15.07	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	HDAC10	Q969S8	669 aa		15.07	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		15.07	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	TASP1	Q9H6P5	420 aa		15.07	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		15.07	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	PRELID1	Q9Y255	219 aa		15.07	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		15.07	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659		M0R3G1	203 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	LDLR	P01130	860 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	CRHBP	P24387	322 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	NAGLU	P54802	743 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	DNAJB13	P59910	316 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	DNASE1L3	Q13609	305 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	SPART	Q8N0X7	666 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	CPXM2	Q8N436	756 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	VPS39	Q96JC1	886 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	BDH2	Q9BUT1	245 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	BAG5	Q9UL15	447 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		15.06	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	AURKA	O14965	403 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	INSIG1	O15503	277 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	FGF19	O95750	216 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	NDST3	O95803	873 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	HPR	P00739	348 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	GFAP	P14136	432 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	CR2	P20023	1033 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	ABCG1	P45844	678 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	RGR	P47804	291 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	CSRP3	P50461	194 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	ARF5	P84085	180 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	IFITM3	Q01628	133 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	AQP6	Q13520	282 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	COQ5	Q5HYK3	327 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	TTC23	Q5W5X9	447 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	ADCK1	Q86TW2	530 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	LSMEM2	Q8N112	164 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	MARK4	Q96L34	752 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	GPR22	Q99680	433 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ 0
BBS1-225	ENST00000630659	MROH6	A6NGR9	719 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	TAF4	O00268	1085 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	LEFTY2	O00292	366 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	GPC4	O75487	556 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	AHSG	P02765	367 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	M6PR	P20645	277 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	IMPDH1	P20839	514 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	CXCR2	P25025	360 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	EPHA5	P54756	1037 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	CDH18	Q13634	790 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	GRM3	Q14832	879 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	CTF1	Q16619	201 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	MPPE1	Q53F39	396 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	SVOP	Q8N4V2	548 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	ZFP90	Q8TF47	636 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC126	Q96EE4	140 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	TRIB3	Q96RU7	358 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		15.05	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	UPK1B	O75841	260 aa		15.04	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	CD160	O95971	181 aa		15.04	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	RB1	P06400	928 aa		15.04	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	CSK	P41240	450 aa		15.04	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	CCR2	P41597	374 aa		15.04	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	15.04	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	CTBP1	Q13363	440 aa		15.04	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	GALNT3	Q14435	633 aa		15.04	■□□□□ -0
BBS1-225	ENST00000630659	ACOX1	Q15067	660 aa		15.04	■□□□□ -0

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