RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 ISCA2Q86U28 154 aa21.17■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM145Q8NBT3 493 aa21.17■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 ACTRT2Q8TDY3 377 aa21.17■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 L3HYPDHQ96EM0 354 aa21.17■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 ADGRE3Q9BY15 652 aa21.17■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 STOML1Q9UBI4 398 aa21.17■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 SPO11Q9Y5K1 396 aa21.17■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa21.17■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 DOCK9Q9BZ29 2069 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 TSPAN11A1L157 253 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 C2orf81A6NN90 581 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 FPGTO14772 594 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 THRAP10827 490 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 IMPDH1P20839 514 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 CCT8P50990 548 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 NXPH1P58417 271 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 ACTR3P61158 418 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 FGL2Q14314 439 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 SEMA3AQ14563 771 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 HERC3Q15034 1050 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF423Q2M1K9 1284 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 AGR3Q8TD06 166 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 STMN2Q93045 179 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 MOCOSQ96EN8 888 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 SLC7A8Q9UHI5 535 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 RAI2Q9Y5P3 530 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM131Q92545 1883 aa21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 A0A1W2PQ67 120 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 SPINT1O43278 529 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 SEMG2Q02383 582 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 PTPRCAPQ14761 206 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM52BQ4KMG9 183 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 PGM2L1Q6PCE3 622 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 FRMD7Q6ZUT3 714 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 ZSWIM9Q86XI8 627 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 POU5F2Q8N7G0 328 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 RHEBL1Q8TAI7 183 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 FAM174AQ8TBP5 190 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 ECHDC3Q96DC8 303 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 SGF29Q96ES7 293 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 NUF2Q9BZD4 464 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 CRYL1Q9Y2S2 319 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC42Q9Y546 428 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 NEMP2A6NFY4 417 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 GIPC1O14908 333 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 SOCS5O75159 536 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 PIRTP0C851 137 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 CD1DP15813 335 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 CD9P21926 228 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 NFKBIAP25963 317 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 EPHA3P29320 983 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 CMPK2Q5EBM0 449 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 Q6ZSR6 202 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 NAXDQ8IW45 347 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 OR13H1Q8NG92 308 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 RHBDD1Q8TEB9 315 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 ASB12Q8WXK4 309 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 CAMK1GQ96NX5 476 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 HACD3Q9P035 362 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 TRPM6Q9BX84 2022 aa21.15■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD36A6QL64 1941 aa21.14■□□□□ 0.98
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 A0A1B0GTQ1 180 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 RGSL1A5PLK6 1076 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA8OA6NCC3 632 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 POM121BA6NF01 834 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 A8MX80 341 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD66B4E2M5 251 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA8NF8WBI6 632 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 RAD51BO15315 384 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 BUD23O43709 281 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 LPOP22079 712 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 PIK3R1P27986 724 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 PMLP29590 882 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 SLC25A3Q00325 362 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 RCN1Q15293 331 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 PIP4P1Q86T03 277 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 OXR1Q8N573 874 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 OR4K2Q8NGD2 314 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 LPGAT1Q92604 370 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 BMFQ96LC9 184 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 PANX3Q96QZ0 392 aa21.14■□□□□ 0.97
SGMS1-210ENST00000619438 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms