RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 CNMDO75829 334 aa20.35■□□□□ 0.85
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PTPRJ-208ENST00000615445 GALNT18Q6P9A2 607 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-208ENST00000615445 ARL10Q8N8L6 244 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD49Q8WVL7 239 aa20.35■□□□□ 0.85
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PTPRJ-208ENST00000615445 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 TLR9Q9NR96 1032 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 TULP3O75386 442 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 ACP5P13686 325 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-208ENST00000615445 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.32■□□□□ 0.84
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