RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582892.1

NF1-222, Transcript of neurofibromin 1, human

TSL 4

Gene NF1, Length 462 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NF1-222	ENST00000582892	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	ZNF567	Q8N184	647 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	MPP5	Q8N3R9	675 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	CPXM2	Q8N436	756 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	RDH11	Q8TC12	318 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	CERS2	Q96G23	380 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	TSGA13	Q96PP4	275 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	ADAM19	Q9H013	955 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	GBA3	Q9H227	469 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	FBRS	Q9HAH7	460 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	CASS4	Q9NQ75	786 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	BFAR	Q9NZS9	450 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	FZD4	Q9ULV1	537 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	SLC12A8	A0AV02	714 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892		M0QYT0	321 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	PLD2	O14939	933 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	SLC31A1	O15431	190 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	UGT1A9	O60656	530 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	PRAMEF10	O60809	474 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	PIAS1	O75925	651 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	TM7SF2	O76062	418 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	LTF	P02788	710 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	SFTPC	P11686	197 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	GM2A	P17900	193 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	ATP6V1C1	P21283	382 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	PTPN3	P26045	913 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	MGAT1	P26572	445 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	PSMB4	P28070	264 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	MAPK1	P28482	360 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	PGM1	P36871	562 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	VHL	P40337	213 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	CSK	P41240	450 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	CHRNA4	P43681	627 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	TKTL1	P51854	596 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	TPI1	P60174	286 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	GALNT2	Q10471	571 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	AP1B1	Q10567	949 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	BLMH	Q13867	455 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	BMPR2	Q13873	1038 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	PCLAF	Q15004	111 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	MANEA	Q5SRI9	462 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	MROH9	Q5TGP6	573 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	IQCH	Q86VS3	1027 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	AHI1	Q8N157	1196 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	LZTR1	Q8N653	840 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	LMLN	Q96KR4	655 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	RBBP8	Q99708	897 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	IL22	Q9GZX6	179 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	PIGV	Q9NUD9	493 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	COMMD8	Q9NX08	183 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	PISD	Q9UG56	409 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	SUN2	Q9UH99	717 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	SARDH	Q9UL12	918 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	EMCN	Q9ULC0	261 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NF1-222	ENST00000582892		K7EM74	188 aa		7.3	□□□□□ -1.24

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