RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580515.5

TSPOAP1-AS1-206, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 980 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TCN2P20062 427 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CCR10P46092 362 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PREPP48147 710 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TUBB4BP68371 445 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TUBB2AQ13885 445 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NLRP9Q7RTR0 991 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PEX13Q92968 403 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HDAC10Q969S8 669 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TUBB2BQ9BVA1 445 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PADI1Q9ULC6 663 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BTRCQ9Y297 605 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FTH1P02794 183 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 APRTP07741 180 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OAS2P29728 719 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RPL22P35268 128 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 POLE2P56282 527 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMTC4Q5T4D3 741 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 AFTPHQ6ULP2 937 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PHC3Q8NDX5 983 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TRIM58Q8NG06 486 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR52E1Q8NGJ3 308 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SGSM3Q96HU1 749 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PPM1MQ96MI6 270 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNF778Q96MU6 729 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC25A18Q9H1K4 315 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LHX9Q9NQ69 397 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C1GALT1Q9NS00 363 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TUBD1Q9UJT1 453 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KCND3Q9UK17 655 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TCAF1Q9Y4C2 921 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GOT2P00505 430 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C4orf22Q6V702 233 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR4L1Q8NH43 312 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR8K5Q8NH50 307 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MAIP1Q8WWC4 291 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ELMO1Q92556 727 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TTC1Q99614 292 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TLR10Q9BXR5 811 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FAM117AQ9C073 453 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BTN3A3O00478 584 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FGGP02679 453 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR56A5P0C7T3 313 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CDH3P22223 829 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CCZ1BP86790 482 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KCNAB2Q13303 367 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GPR19Q15760 415 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C16orf46Q6P387 395 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNF534Q76KX8 674 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 AMIGO1Q86WK6 493 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LATS2Q9NRM7 1088 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KCND1Q9NSA2 647 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SOHLH2Q9NX45 425 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC5A10A0PJK1 596 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GSAPA4D1B5 854 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BTN3A1O00481 513 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC28A2O43868 658 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR1I1O60431 355 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NTRK1P04629 796 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ACADLP28330 430 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR6P1Q8NGX9 317 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NRTNQ99748 197 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HGH1Q9BTY7 390 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PITPNM3Q9BZ71 974 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C21orf140B9A014 251 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RECKO95980 971 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PRAMEP78395 509 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PRKG2Q13237 762 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DNASE1L3Q13609 305 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DEFB109BQ30KR1 87 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PCID2Q5JVF3 399 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CT55Q8WUE5 264 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SYTL2Q9HCH5 934 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BSNQ9UPA5 3926 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 F8W8V4 182 aa23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms