RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	VPS4A	Q9UN37	437 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	POLH	Q9Y253	713 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	ITPR3	Q14573	2671 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	LILRA5	A6NI73	299 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	ARGFX	A6NJG6	315 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	NOTO	A8MTQ0	251 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	C22orf46	C9J442	243 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	PSMD11	O00231	422 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	GSTA4	O15217	222 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	SNX2	O60749	519 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	SOCS5	O75159	536 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	CREG1	O75629	220 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	NDUFA10	O95299	355 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	PGLS	O95336	258 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	LDLR	P01130	860 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	C9	P02748	559 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	KRT3	P12035	628 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	PRF1	P14222	555 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	TCF4	P15884	667 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	ERCC2	P18074	760 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	TACR1	P25103	407 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	TEAD1	P28347	426 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	BCL6	P41182	706 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	GPR1	P46091	355 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	BPIFB4	P59827	614 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	AP1S1	P61966	158 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	MC1R	Q01726	317 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	CDR2	Q01850	454 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	GUCY1A3	Q02108	690 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	MVK	Q03426	396 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	DPT	Q07507	201 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	FOXM1	Q08050	763 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	IL10RB	Q08334	325 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	SEMA5A	Q13591	1074 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	KCNAB1	Q14722	419 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	CAMK4	Q16566	473 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	LRRC66	Q68CR7	880 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF677	Q86XU0	584 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	GPR150	Q8NGU9	434 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	AP2M1	Q96CW1	435 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	C19orf60	Q96EN9	201 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	C9orf72	Q96LT7	481 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	TGM7	Q96PF1	710 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	PSKH2	Q96QS6	385 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	RANBP9	Q96S59	729 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	MGME1	Q9BQP7	344 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	ZPBP	Q9BS86	351 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	NUDT9	Q9BW91	350 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	STK33	Q9BYT3	514 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	ACTL8	Q9H568	366 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	DTL	Q9NZJ0	730 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79

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