RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	POMT2	Q9UKY4	750 aa		21.17	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	NKX2-8	O15522	239 aa		21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA0754	O94854	1291 aa		21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	ACY1	Q03154	408 aa		21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBB3	Q13509	450 aa		21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	PCID2	Q5JVF3	399 aa		21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	PDE7B	Q9NP56	450 aa		21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	FGF21	Q9NSA1	209 aa		21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	TREX1	Q9NSU2	369 aa		21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	BTRC	Q9Y297	605 aa		21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		21.16	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	21.15	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	MATN2	O00339	956 aa		21.15	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	BTN3A3	O00478	584 aa		21.15	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	NRDC	O43847	1150 aa		21.15	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	FTH1	P02794	183 aa		21.15	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGB6	P18564	788 aa		21.15	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	F8A1	P23610	371 aa		21.15	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	21.15	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		21.15	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		21.15	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		21.15	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		21.15	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	21.15	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		21.15	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	ELMO1	Q92556	727 aa		21.15	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	RARRES3	Q9UL19	164 aa		21.15	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC16A	O15027	2179 aa		21.15	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	OR56A5	P0C7T3	313 aa		21.14	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM87A	P0C7U9	286 aa		21.14	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	21.14	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBB4B	P68371	445 aa		21.14	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAME	P78395	509 aa		21.14	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	CRADD	P78560	199 aa		21.14	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	21.14	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBB2A	Q13885	445 aa		21.14	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	21.14	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		21.14	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		21.14	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		21.14	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		21.14	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	IL22	Q9GZX6	179 aa		21.14	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		21.14	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		21.14	■□□□□ 0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	BTN3A1	O00481	513 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	NPY2R	P49146	381 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	CDK16	Q00536	496 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKAA1	Q13131	559 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKG2	Q13237	762 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	BORA	Q6PGQ7	559 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	STARD8	Q92502	1023 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC1	Q99614	292 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	HGH1	Q9BTY7	390 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200		B8ZZF3	427 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	TPBGL	P0DKB5	382 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	TPSB2	P20231	275 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL4D	P49703	201 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	TPSAB1	Q15661	275 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC27	Q6P3X3	843 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF605	Q86T29	641 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	CATSPER2	Q96P56	530 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	STARD5	Q9NSY2	213 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	CROT	Q9UKG9	612 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ICK	Q9UPZ9	632 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	CDYL	Q9Y232	598 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	AP3B1	O00203	1094 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	MT-ND3	P03897	115 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	PLA2G2A	P14555	144 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	CCR7	P32248	378 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	DLST	P36957	453 aa		21.12	■□□□□ 0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGEA6	P43360	314 aa		21.12	■□□□□ 0.97

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