RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	B3GALT6	Q96L58	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PANX2	Q96RD6	677 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CISH	Q9NSE2	258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	COG5	Q9UP83	839 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CIT	O14578	2027 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SCN1A	P35498	2009 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	BRCA2	P51587	3418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934		A0A087X0T9	212 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	FAM170A	A1A519	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934		A8MXQ7	604 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF263	O14978	683 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	HUS1	O60921	280 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	OAZ2	O95190	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SERPING1	P05155	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TPM1	P09493	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	FAM228B	P0C875	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	P4HA1	P13674	534 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	FER	P16591	822 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TYMP	P19971	482 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PRKCI	P41743	596 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	NDST1	P52848	882 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	GAD2	Q05329	585 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ETFDH	Q16134	617 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	MEA1	Q16626	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TAF3	Q5VWG9	929 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	FUT10	Q6P4F1	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC43	Q8N309	656 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	C12orf29	Q8N999	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	RAD9A	Q99638	391 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SPG21	Q9NZD8	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms