RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.38■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 BIRC8Q96P09 236 aa20.38■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 PANX3Q96QZ0 392 aa20.38■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 HGH1Q9BTY7 390 aa20.38■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 RAB33BQ9H082 229 aa20.38■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 OCIAD1Q9NX40 245 aa20.38■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 CDYLQ9Y232 598 aa20.38■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 CRYL1Q9Y2S2 319 aa20.38■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 SNX24Q9Y343 169 aa20.38■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.38■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 OR6C74A6NCV1 312 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 OR5K3A6NET4 321 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 FAM187AA6NFU0 413 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 EFCAB7A8K855 629 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 RAD51CO43502 376 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 PRAMEF10O60809 474 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 RASSF9O75901 435 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 APOA4P06727 396 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 AOAHP28039 575 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 FMO4P31512 558 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 PRKG2Q13237 762 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 TMED2Q15363 201 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 HIF1AQ16665 826 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 FAM92BQ6ZTR7 304 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 OOSP2Q86WS3 158 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 SLC22A15Q8IZD6 547 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 UNC5BQ8IZJ1 945 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF248Q8NDW4 579 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 OR5AR1Q8NGP9 310 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ASZ1Q8WWH4 475 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ART4Q93070 314 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 FOXJ2Q9P0K8 574 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ASF1AQ9Y294 204 aa20.37■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 B4E171 279 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 C9orf172C9J069 976 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 NVLO15381 856 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 RRP8O43159 456 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 NIPSNAP2O75323 286 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 GPC4O75487 556 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 TTC4O95801 387 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 S1PR4O95977 384 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ESR1P03372 595 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 TSPAN7P41732 249 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 SLC1A2P43004 574 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ARL4CP56559 192 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 CTBP1Q13363 440 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 PRSS42Q7Z5A4 293 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 KCNMB4Q86W47 210 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 BMPERQ8N8U9 685 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 OR4E2Q8NGC2 313 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 LCN9Q8WX39 176 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 PMEPA1Q969W9 287 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 NRTNQ99748 197 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ERP44Q9BS26 406 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 NAT9Q9BTE0 207 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 CDC23Q9UJX2 597 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa20.36■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 H3BMM5 538 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 URI1O94763 535 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 SLCO2B1O94956 709 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ELK3P41970 407 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 SEPHS1P49903 392 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 SPANXN3Q5MJ09 141 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 CACHD1Q5VU97 1274 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 CALML6Q8TD86 181 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 KCNE4Q8WWG9 221 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF592Q92610 1267 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 TAAR9Q96RI9 348 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 FAM167BQ9BTA0 163 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 DPH5Q9H2P9 285 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 SRMSQ9H3Y6 488 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 PLAC1Q9HBJ0 212 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 SLC39A1Q9NY26 324 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 ACSL6Q9UKU0 697 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD3-203ENST00000558455 CHMP2BQ9UQN3 213 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms