RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 VAPBO95292 243 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 ZNF28P17035 718 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 MAGEA3P43357 314 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 GNG11P61952 73 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 FOXM1Q08050 763 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 PRKG2Q13237 762 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 KRT33BQ14525 404 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 CEACAM20Q6UY09 585 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 OOSP2Q86WS3 158 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 KRT222Q8N1A0 295 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 MCUQ8NE86 351 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 OR5AR1Q8NGP9 310 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 SERPINB12Q96P63 405 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 OR6C1Q96RD1 312 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 P2RY12Q9H244 342 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 CDYLQ9Y232 598 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 TLCD2A6NGC4 264 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 BTN3A3O00478 584 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 RAD1O60671 282 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 DLGAP3O95886 979 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 TPBGLP0DKB5 382 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 FOLR1P15328 257 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 TCP1P17987 556 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 MANEAQ5SRI9 462 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 LCN9Q8WX39 176 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 UBXN4Q92575 508 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 TTC1Q99614 292 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 XKR8Q9H6D3 395 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 POMT2Q9UKY4 750 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 FASNP49327 2511 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 BTN3A1O00481 513 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 STK17BO94768 372 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 MLNP12872 115 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 TTPAP49638 278 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 SYTL3Q4VX76 610 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 CREG2Q8IUH2 290 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 ELMO2Q96JJ3 720 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 CD180Q99467 661 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 ZPBPQ9BS86 351 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 CARD6Q9BX69 1037 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 SRMSQ9H3Y6 488 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 ANAPC5Q9UJX4 755 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 ICKQ9UPZ9 632 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 GPC4O75487 556 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 TIAF1O95411 115 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 EBLN1P0CF75 366 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 PTGIRP43119 386 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 SARNPP82979 210 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 CTSL3PQ5NE16 218 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 CASC4Q6P4E1 433 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 SLC22A15Q8IZD6 547 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 GRK7Q8WTQ7 553 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 LPGAT1Q92604 370 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 TTC9Q92623 222 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 ASF1AQ9Y294 204 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-222ENST00000550996 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.26■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 FGF5P12034 268 aa20.26■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 LIFP15018 202 aa20.26■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 AOAHP28039 575 aa20.26■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 ATP1A2P50993 1020 aa20.26■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 HSPA14Q0VDF9 509 aa20.26■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.26■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 UNC5BQ8IZJ1 945 aa20.26■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 D2HGDHQ8N465 521 aa20.26■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 SLCO2A1Q92959 643 aa20.26■□□□□ 0.83
CS-222ENST00000550996 BIRC8Q96P09 236 aa20.26■□□□□ 0.83
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