RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550379.1

RNF41-208, Transcript of ring finger protein 41, human

TSL 3

Gene RNF41, Length 525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF41-208	ENST00000550379	CSHL1	Q14406	222 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	ELOC	Q15369	112 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	TGFBI	Q15582	683 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	PDK4	Q16654	411 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	IYD	Q6PHW0	289 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	TRIM74	Q86UV6	250 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	PIM3	Q86V86	326 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	NRROS	Q86YC3	692 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	ATL1	Q8WXF7	558 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	DLG3	Q92796	817 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	PTER	Q96BW5	349 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	LINGO1	Q96FE5	620 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	PDXP	Q96GD0	296 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	CCDC138	Q96M89	665 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	FOPNL	Q96NB1	174 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	MENT	Q9BUN1	341 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	FZD3	Q9NPG1	666 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	SPAST	Q9UBP0	616 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	KNTC1	P50748	2209 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379		A0A1B0GTQ1	180 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	NEMP2	A6NFY4	417 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	SCAMP1	O15126	338 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	TRIM13	O60858	407 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	C1orf105	O95561	183 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	RET	P07949	1114 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	CPA3	P15088	417 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	PNLIP	P16233	465 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	TAC1	P20366	129 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	IMPDH1	P20839	514 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	CYP2A7	P20853	494 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	CCND1	P24385	295 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	NBL1	P41271	181 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	ABCG1	P45844	678 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	SERPINB4	P48594	390 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	HK2	P52789	917 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	IL9R	Q01113	521 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	BNC1	Q01954	994 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF33B	Q06732	778 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	SQSTM1	Q13501	440 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	NR1D2	Q14995	579 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	PCLAF	Q15004	111 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	CYP2A13	Q16696	494 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	KCTD16	Q68DU8	428 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	GPSM1	Q86YR5	675 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	VRK3	Q8IV63	474 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	SFRP1	Q8N474	314 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	FBXL8	Q96CD0	374 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	CNDP1	Q96KN2	507 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RNF41-208	ENST00000550379	RAB33B	Q9H082	229 aa		7.5	□□□□□ -1.21

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