RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 SFXN1Q9H9B4 322 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ACSL5Q9ULC5 683 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PQ72 361 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 RENP00797 406 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 GRK6P43250 576 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MYBPC3Q14896 1274 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TPRG1Q6ZUI0 275 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ARL10Q8N8L6 244 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TBATAQ96M53 351 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SLC32A1Q9H598 525 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 CD320Q9NPF0 282 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 PNPOQ9NVS9 261 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 WBP4O75554 376 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ARHGEF15O94989 841 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SEC24AO95486 1093 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 OAS1P00973 400 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 PIK3R6Q5UE93 754 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 IL23RQ5VWK5 629 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MINDY2Q8NBR6 621 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 DTLQ9NZJ0 730 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 DNAJB9Q9UBS3 223 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 AK5Q9Y6K8 562 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 KDM3BQ7LBC6 1761 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MYBPHLA2RUH7 354 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 E2F3O00716 465 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SNPHO15079 494 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 NBNO60934 754 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ITPKAP23677 461 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 EPHA3P29320 983 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 UGT1A3P35503 534 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 DNAJB13P59910 316 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 GMFBP60983 142 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 IL18R1Q13478 541 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 IZUMO1Q8IYV9 350 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 NAT16Q8N8M0 369 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 PYDC1Q8WXC3 89 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 DSN1Q9H410 356 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 CDH22Q9UJ99 828 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 OR1F1O43749 312 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 CBFA2T3O75081 653 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 CYB5AP00167 134 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 RAP2AP10114 183 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 THRBP10828 461 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MPSTP25325 297 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 CCKBRP32239 447 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ACTR1BP42025 376 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ZSWIM7Q19AV6 140 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 PJA1Q8NG27 643 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TFAP2BQ92481 460 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 DNASE1L2Q92874 299 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 EXOC2Q96KP1 924 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 CHRAC1Q9NRG0 131 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SUSD2Q9UGT4 822 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SCML1Q9UN30 329 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PQY0 241 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 BCKDKO14874 412 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 APBB3O95704 486 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 HSD3B1P14060 373 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 HSD3B2P26439 372 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 FOLH1Q04609 750 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC17Q8N6Y2 441 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 OR7D4Q8NG98 312 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 KIFC1Q9BW19 673 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ALG2Q9H553 416 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MINDY3Q9H8M7 445 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms