RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 C21orf140B9A014 251 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 SGTAO43765 313 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 EBLN1P0CF75 366 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 FOLR1P15328 257 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 PPP1CAP62136 330 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 RPS15P62841 145 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 SNX1Q13596 522 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 DBN1Q16643 649 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 OR6P1Q8NGX9 317 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 NAT14Q8WUY8 206 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 ELMO1Q92556 727 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 LHX9Q9NQ69 397 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 HOMER3Q9NSC5 361 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 IL17BQ9UHF5 180 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 POLG2Q9UHN1 485 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 RIMKLBQ9ULI2 386 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 POLHQ9Y253 713 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa16.46■□□□□ 0.23
CASP9-211ENST00000546969 A0A0U1RQJ8 604 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 PIPSLA2A3N6 862 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 CCDC78A2IDD5 438 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 C2orf74A8MZ97 194 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 SUN1O94901 812 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 APRTP07741 180 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 ZNF28P17035 718 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 DNASE1L3Q13609 305 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 KCNAB1Q14722 419 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 CCNG2Q16589 344 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 CCDC38Q502W7 563 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 PACS1Q6VY07 963 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 AMIGO1Q86WK6 493 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 CLDN19Q8N6F1 224 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 RANBP9Q96S59 729 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 GPR87Q9BY21 358 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 OR52A5Q9H2C5 316 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 LZTFL1Q9NQ48 299 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 SERTAD3Q9UJW9 196 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 POMT2Q9UKY4 750 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 ASF1AQ9Y294 204 aa16.45■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 CCDC162PA2VCL2 907 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 SCRG1O75711 98 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 RECKO95980 971 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 PREPP48147 710 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 KCNC4Q03721 635 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 SEMA5AQ13591 1074 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 TSTD2Q5T7W7 516 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 PIANPQ8IYJ0 282 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 PHC3Q8NDX5 983 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 TRIM58Q8NG06 486 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 OR4L1Q8NH43 312 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 GSDMBQ8TAX9 411 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 CPT1BQ92523 772 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 PEX13Q92968 403 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 HDAC10Q969S8 669 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 HGH1Q9BTY7 390 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 TWSG1Q9GZX9 223 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 LATS2Q9NRM7 1088 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 BTRCQ9Y297 605 aa16.44■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 MKRN2OSH3BPM6 223 aa16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 PFDN6O15212 129 aa16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 CREG1O75629 220 aa16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 NTRK1P04629 796 aa16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 RPN2P04844 631 aa16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 CYP2A7P20853 494 aa16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 PSMA3P25788 255 aa16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 OAS2P29728 719 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 SHMT2P34897 504 aa16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 PRKG2Q13237 762 aa16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 ERV3-1Q14264 604 aa16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 TBC1D21Q8IYX1 336 aa16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 OR52E1Q8NGJ3 308 aa16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 MR1Q95460 341 aa16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 BFARQ9NZS9 450 aa16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa16.43■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 CDC14CA4D256 554 aa16.42■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 GOT2P00505 430 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 HBQ1P09105 142 aa16.42■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 PRSS56P0CW18 603 aa16.42■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 ITGB6P18564 788 aa16.42■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 PDHA2P29803 388 aa16.42■□□□□ 0.22
CASP9-211ENST00000546969 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms