RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 KLHL22Q53GT1 634 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RFWD3Q6PCD5 774 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FAM129CQ86XR2 697 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FAM13CQ8NE31 585 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DBF4BQ8NFT6 615 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FBRSQ9HAH7 460 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ACP6Q9NPH0 428 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DOCK1Q14185 1865 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 A0A0U1RQF3 1178 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 WASHC1A8K0Z3 465 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 WASH3PC4AMC7 463 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 KMOO15229 486 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SLC31A1O15431 190 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 VEGFDO43915 354 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TACSTD2P09758 323 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 IGFBP5P24593 272 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GNALP38405 381 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 QPRTQ15274 297 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 WASH2PQ6VEQ5 465 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FAM81AQ8TBF8 368 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PSMG2Q969U7 264 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RCN3Q96D15 328 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PLK2Q9NYY3 685 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 COQ4Q9Y3A0 265 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 KIF13BQ9NQT8 1826 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SMCHD1A6NHR9 2005 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SLC30A4O14863 429 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SCELO95171 688 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF823P16415 610 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF3P17036 446 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CSKP41240 450 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DGKEP52429 567 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RAPSNQ13702 412 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TAC4Q86UU9 113 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NXNL1Q96CM4 212 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 C8orf48Q96LL4 319 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CLDND1Q9NY35 253 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 COL20A1Q9P218 1284 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PDCD5O14737 125 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SSNA1O43805 119 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SOX30O94993 753 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 OR5F1O95221 314 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GJA9P57773 515 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PCM1Q15154 2024 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MED22Q15528 200 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SNAPC1Q16533 368 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CYP1B1Q16678 543 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RGS21Q2M5E4 152 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RNF148Q8N7C7 305 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PIK3R3Q92569 461 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RNF31Q96EP0 1072 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ALG2Q9H553 416 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SLX4Q8IY92 1834 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FAM92AA1XBS5 289 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MAGEB17A8MXT2 336 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 H0YGN5 161 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 REM1O75628 298 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 KLHL18O94889 574 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SEC24AO95486 1093 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ALPIP09923 528 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GSTT2BP0CG30 244 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TSPAN8P19075 237 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CTSKP43235 329 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 HSPA7P48741 367 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PITPNAQ00169 270 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 KCNC3Q14003 757 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TTMPQ5BVD1 217 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MCUBQ9NWR8 336 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 P2RX2Q9UBL9 471 aa6.3□□□□□ -1.4
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