RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541456.1

PRR4-209, Transcript of proline rich 4, human

TSL 3

Gene PRR4, Length 454 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR4-209	ENST00000541456	ATG13	O75143	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	SBK2	P0C263	348 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	SRD5A1	P18405	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	OTX2	P32243	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	NPBWR1	P48145	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	HTR6	P50406	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63	2e-7	■■■■■ 30.8
PRR4-209	ENST00000541456	CCNA1	P78396	465 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	REST	Q13127	1097 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	TNK1	Q13470	666 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	LEMD2	Q8NC56	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	RIT1	Q92963	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	FEV	Q99581	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	ERP44	Q9BS26	406 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	P2RY12	Q9H244	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	RAI14	Q9P0K7	980 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	SNX6	Q9UNH7	406 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	KDR	P35968	1356 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456		A0A087WZY1	265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	CLIC1	O00299	241 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	CXCL11	O14625	94 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	CYTIP	O60759	359 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	FCGR3B	O75015	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	CREG1	O75629	220 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	OR6B1	O95007	311 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	MT-CO3	P00414	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	CXCL10	P02778	98 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	PGK2	P07205	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	NDUFB7	P17568	137 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	PSMA5	P28066	241 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	TMOD1	P28289	359 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	PTEN	P60484	403 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	SPIB	Q01892	262 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	GAD2	Q05329	585 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	IFT88	Q13099	833 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	IDI1	Q13907	227 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	GPR180	Q86V85	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRR4-209	ENST00000541456	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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