RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528252.5

SOX6-210, Transcript of SRY-box 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SOX6, Length 2,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6-210ENST00000528252 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 STON2Q8WXE9 905 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 OTUB2Q96DC9 234 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 MEAF6Q9HAF1 191 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 CD274Q9NZQ7 290 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 B4GALT6Q9UBX8 382 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 PACSIN3Q9UKS6 424 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 RAB26Q9ULW5 256 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 ERVW-1Q9UQF0 538 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 POMPQ9Y244 141 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 KDM1AO60341 852 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 GPC4O75487 556 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 S100BP04271 92 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 ITGAXP20702 1163 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 ACRV1P26436 265 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 ALDH3B2P48448 385 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 PCYT1AP49585 367 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 CDH15P55291 814 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 RAB15P59190 212 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 KCNC4Q03721 635 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 UGT3A2Q3SY77 523 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 GPR33Q49SQ1 333 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 FAAH2Q6GMR7 532 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 GDPD4Q6W3E5 623 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 PQLC1Q8N2U9 271 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 NXPE1Q8N323 547 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 ZNF366Q8N895 744 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 C3orf30Q96M34 536 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 KCNA7Q96RP8 456 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 MARK1Q9P0L2 795 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 DPP7Q9UHL4 492 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 CDH22Q9UJ99 828 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 POU2F3Q9UKI9 436 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 PPIL1Q9Y3C6 166 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 ALPK3Q96L96 1907 aa8.09□□□□□ -1.11
SOX6-210ENST00000528252 KRBA1A5PL33 1030 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 NOTOA8MTQ0 251 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 TNFRSF10AO00220 468 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 AZIN1O14977 448 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 SNX2O60749 519 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 SULT1C4O75897 302 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 CYP17A1P05093 508 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 CD247P20963 164 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 NNMTP40261 264 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 NUDT2P50583 147 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 LCP2Q13094 533 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 FRS2Q8WU20 508 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 JADE3Q92613 823 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 NACC2Q96BF6 587 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ISOC1Q96CN7 298 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 C19orf60Q96EN9 201 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ZFYVE19Q96K21 471 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ASB2Q96Q27 587 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 C19orf43Q9BQ61 176 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 RTKNQ9BST9 563 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 HAUS8Q9BT25 410 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 GNPTGQ9UJJ9 305 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ASB1Q9Y576 335 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.09□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 UBDO15205 165 aa8.08□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 LEFTY1O75610 366 aa8.08□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ATE1O95260 518 aa8.08□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 FGF4P08620 206 aa8.08□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 RPS17P08708 135 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 NRIP1P48552 1158 aa8.08□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 MESP2Q0VG99 397 aa8.08□□□□□ -1.12
SOX6-210ENST00000528252 E2F2Q14209 437 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms