RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 OR52Z1P0C646 297 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC192P0DO97 292 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 HKR1P10072 659 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 KRT3P12035 628 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 KELP23276 732 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SLC9A3P48764 834 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ADORA2A-AS1P86434 159 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SPOCK1Q08629 439 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 GRIK3Q13003 919 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TP53BP2Q13625 1128 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 KRT33BQ14525 404 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 FAM153CQ494X1 144 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ALG10Q5BKT4 473 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ALG10BQ5I7T1 473 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 LY6G5CQ5SRR4 150 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 FRG2Q64ET8 278 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM211Q6ICI0 200 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 KDELC1Q6UW63 502 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC13Q8IYE1 715 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 GCSAMQ8N6F7 178 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF611Q8N823 705 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 LINC00476Q8WZB0 136 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ERLEC1Q96DZ1 483 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 INTS14Q96SY0 518 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 FEVQ99581 238 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TIMP4Q99727 224 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 LMAN1LQ9HAT1 526 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SERINC1Q9NRX5 453 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 DPP3Q9NY33 737 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 NINJ2Q9NZG7 142 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 OR14J1Q9UGF5 321 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CTNNA3Q9UI47 895 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 THSD7BQ9C0I4 1608 aa2.21□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 LAMB1P07942 1786 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SLIT3O75094 1523 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TULP4Q9NRJ4 1543 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CLRN2A0PK11 232 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 INPPL1O15357 1258 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ESRRBO95718 433 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ICAM1P05362 532 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MYL6BP14649 208 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CD27P26842 260 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ADRA1BP35368 520 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 HSD17B3P37058 310 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MFAP3P55082 362 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 STXBP2Q15833 593 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SGCBQ16585 318 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 WSCD2Q2TBF2 565 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SYTL3Q4VX76 610 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SPATA46Q5T0L3 261 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 DCST1Q5T197 706 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 GALNT17Q6IS24 598 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SLC27A1Q6PCB7 646 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ENPP7Q6UWV6 458 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 OLFM4Q6UX06 510 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 KCTD9Q7L273 389 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MCM10Q7L590 875 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ARMC9Q7Z3E5 817 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM74Q86UV6 250 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM73Q86UV7 250 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D21Q8IYX1 336 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SLC25A41Q8N5S1 370 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 DBF4BQ8NFT6 615 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 NCOA7Q8NI08 942 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 PDLIM2Q96JY6 352 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF558Q96NG5 402 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 FCRL5Q96RD9 977 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MLST8Q9BVC4 326 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TKTL2Q9H0I9 626 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 FZD8Q9H461 694 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MIS18AQ9NYP9 233 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 POLLQ9UGP5 575 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 AURKCQ9UQB9 309 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ITM2BQ9Y287 266 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 STON1Q9Y6Q2 735 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CPDO75976 1380 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 A0A0A0MQY5 61 aa2.2□□□□□ -2.06
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PDE4D-218ENST00000509368 IDH1O75874 414 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 RNF8O76064 485 aa2.2□□□□□ -2.06
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